Transcriptomic and genomic heterogeneity in blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasms: from ontogeny to oncogenesis
Florian Renosi
(1)
,
Anne Roggy
(2)
,
Ambre Giguelay
(3, 4, 5)
,
Lou Soret
(1)
,
Pierre-Julien Viailly
(6)
,
Meyling Cheok
(7)
,
Sabeha Biichle
(1)
,
Fanny Angelot-Delettre
(1, 8, 9)
,
Vahid Asnafi
(10)
,
Elizabeth Macintyre
(10)
,
Sandrine Geffroy
(7, 11)
,
Mary Callanan
(12, 13)
,
Tony Petrella
(14, 15)
,
Eric Deconinck
(1)
,
Etienne Daguindau
(1)
,
Véronique Harrivel
(16)
,
Sabrina Bouyer
(17)
,
Véronique Salaün
(18)
,
Pascale Saussoy
(19)
,
Jean Feuillard
(20)
,
Pascal Fuseau
(21)
,
Philippe Saas
(1)
,
Olivier Adotévi
(1)
,
Fabrice Jardin
(4, 5)
,
Christophe Ferrand
(1, 22)
,
Claude Preudhomme
(7, 11)
,
Jacques Colinge
(3, 4, 23)
,
Christophe Roumier
(7, 24)
,
Francine Garnache-Ottou
(1, 22)
1
RIGHT -
Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098)
2 EFS BFC (site de Dijon) - Etablissement Français du Sang de Bourgogne Franche-Comté (site de Dijon)
3 ICM - Institut régional de Cancérologie de Montpellier
4 IRCM - U1194 Inserm - UM - Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier
5 ICM - UNICANCER - Institut régional du Cancer Montpellier Val d'Aurelle
6 CLCC Henri Becquerel - Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen
7 CANTHER - Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277
8 LabEx LipSTIC - Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer
9 EFS BFC (site de Chalon-sur-Saône) - Etablissement Français du Sang de Bourgogne Franche-Comté (site de Chalon-sur-Saône)
10 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
11 Institut de Pathologie [CHU Lille]
12 IAB - Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble)
13 Equipe CADIR (LNC - U1231)
14 UQAM - Université du Québec à Montréal = University of Québec in Montréal
15 Hôpital Maisonneuve-Rosemont
16 CHU Amiens-Picardie
17 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
18 CHU Caen
19 Cliniques universitaires St Luc [Bruxelles]
20 Hôpital Dupuytren [CHU Limoges]
21 CHU de la Martinique [Fort de France]
22 EFS BFC - Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté]
23 UM - Université de Montpellier
24 Service de pathologie [CHU Lille]
2 EFS BFC (site de Dijon) - Etablissement Français du Sang de Bourgogne Franche-Comté (site de Dijon)
3 ICM - Institut régional de Cancérologie de Montpellier
4 IRCM - U1194 Inserm - UM - Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier
5 ICM - UNICANCER - Institut régional du Cancer Montpellier Val d'Aurelle
6 CLCC Henri Becquerel - Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen
7 CANTHER - Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277
8 LabEx LipSTIC - Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer
9 EFS BFC (site de Chalon-sur-Saône) - Etablissement Français du Sang de Bourgogne Franche-Comté (site de Chalon-sur-Saône)
10 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
11 Institut de Pathologie [CHU Lille]
12 IAB - Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble)
13 Equipe CADIR (LNC - U1231)
14 UQAM - Université du Québec à Montréal = University of Québec in Montréal
15 Hôpital Maisonneuve-Rosemont
16 CHU Amiens-Picardie
17 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
18 CHU Caen
19 Cliniques universitaires St Luc [Bruxelles]
20 Hôpital Dupuytren [CHU Limoges]
21 CHU de la Martinique [Fort de France]
22 EFS BFC - Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté]
23 UM - Université de Montpellier
24 Service de pathologie [CHU Lille]
Florian Renosi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1284961
- ORCID : 0000-0002-6149-0547
Lou Soret
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1284963
- ORCID : 0000-0002-6183-0046
Pierre-Julien Viailly
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1284964
- ORCID : 0000-0002-9636-8971
Meyling Cheok
- Fonction : Auteur
- PersonId : 769023
- ORCID : 0000-0002-7820-8026
- IdRef : 19092876X
Fanny Angelot-Delettre
- Fonction : Auteur
Vahid Asnafi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1252576
- ORCID : 0000-0002-6255-5314
Elizabeth Macintyre
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762165
- ORCID : 0000-0003-0520-0493
Tony Petrella
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1239979
- ORCID : 0000-0002-7099-8107
Eric Deconinck
- Fonction : Auteur
- PersonId : 759821
- ORCID : 0000-0002-6006-8088
Jean Feuillard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1284965
- ORCID : 0000-0001-6223-2454
Olivier Adotévi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1177838
- ORCID : 0000-0002-7742-136X
Fabrice Jardin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1284966
- ORCID : 0000-0002-6804-7943
Christophe Ferrand
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757737
- ORCID : 0000-0003-0119-3919
Claude Preudhomme
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762197
- ORCID : 0000-0002-1267-9546
- IdRef : 07342255X
Jacques Colinge
- Fonction : Auteur
- PersonId : 184393
- IdHAL : jacques-colinge
- ORCID : 0000-0003-2466-4824
Francine Garnache-Ottou
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1239977
- ORCID : 0000-0002-6930-9554
Résumé
Oncogenesis and ontogeny of blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm (BPDCN) remain uncertain, between canonical plasmacytoid dendritic cells (pDCs) and AXL+ SIGLEC6+ DCs (AS-DCs). We compared 12 BPDCN to 164 acute leukemia by Affymetrix HG-U133 Plus 2.0 arrays: BPDCN were closer to B-cell acute lymphoblastic leukemia (ALL), with enrichment in pDC, B-cell signatures, vesicular transport, deubiquitination pathways, and AS-DC signatures, but only in some cases. Importantly, 1 T-cell ALL clustered with BPDCN, with compatible morphology, immunophenotype (cCD3+ sCD3− CD123+ cTCL1+ CD304+), and genetics. Many oncogenetic pathways are deregulated in BPDCN compared with normal pDC, such as cell-cycle kinases, and importantly, the transcription factor SOX4, involved in B ontogeny, pDC ontogeny, and cancer cell invasion. High-throughput sequencing (HaloPlex) showed myeloid mutations (TET2, 62%; ASXL1, 46%; ZRSR2, 31%) associated with lymphoid mutations (IKZF1), whereas single-nucleotide polymorphism (SNP) array (Affymetrix SNP array 6.0) revealed frequent losses (mean: 9 per patient) involving key hematological oncogenes (RB1, IKZF1/2/3, ETV6, NR3C1, CDKN2A/B, TP53) and immune response genes (IFNGR, TGFB, CLEC4C, IFNA cluster). Various markers suggest an AS-DC origin, but not in all patients, and some of these abnormalities are related to the leukemogenesis process, such as the 9p deletion, leading to decreased expression of genes encoding type I interferons. In addition, the AS-DC profile is only found in a subgroup of patients. Overall, the cellular ontogenic origin of BPDCN remains to be characterized, and these results highlight the heterogeneity of BPDCN, with a risk of a diagnostic trap.