ABCA7 rare variants and Alzheimer disease risk
Kilan Le Guennec
(1)
,
Gaël Nicolas
(1, 2)
,
Olivier Quenez
(1, 2)
,
Camille Charbonnier
(1)
,
David Wallon
(3)
,
Céline Bellenguez
(4)
,
Benjamin Grenier-Boley
(4)
,
Stéphane Rousseau
(1)
,
Anne-Claire Richard
(5)
,
Anne Rovelet-Lecrux
(1)
,
Delphine Bacq
,
Jean-Guillaume Garnier
(6)
,
Robert Olaso
(6)
,
Anne Boland
(6)
,
Vincent Meyer
(7)
,
Jean-François Deleuze
(8)
,
Philippe Amouyel
(9)
,
Hans Markus Munter
(10)
,
Guillaume Bourque
(10)
,
Mark Lathrop
,
Thierry Frebourg
,
Richard Redon
(11)
,
Luc Letenneur
,
Jean-François Dartigues
,
Florence Pasquier
,
Adeline Rollin-Sillaire
,
Emmanuelle Génin
(12)
,
Jean-Charles Lambert
,
Didier Hannequin
,
Dominique Campion
,
Olivier Godefroy
(13, 14)
1
GMFC -
Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques
2 GPMCND - Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques
3 Service de neurologie [Rouen]
4 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
5 IRIB - Institute for Research and Innovation in Biomedicine
6 CNG - Centre National de Génotypage
7 Lafarge LCR Lyon - Lafarge Centre de Recherche [Lyon]
8 Centre de Ressources Biologiques [Evry]
9 RID-AGE - Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167
10 McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
11 ITX - ITX - unité de recherche de l'institut du thorax
12 GGB - Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078)
13 CHU Amiens-Picardie
14 LNFP - Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559
2 GPMCND - Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques
3 Service de neurologie [Rouen]
4 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
5 IRIB - Institute for Research and Innovation in Biomedicine
6 CNG - Centre National de Génotypage
7 Lafarge LCR Lyon - Lafarge Centre de Recherche [Lyon]
8 Centre de Ressources Biologiques [Evry]
9 RID-AGE - Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167
10 McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
11 ITX - ITX - unité de recherche de l'institut du thorax
12 GGB - Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078)
13 CHU Amiens-Picardie
14 LNFP - Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559
Gaël Nicolas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178691
- IdHAL : gael-nicolas1
- ORCID : 0000-0001-9391-7800
- IdRef : 165828412
Olivier Quenez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178034
- IdHAL : olivier-quenez
- ORCID : 0000-0002-8273-8505
- IdRef : 253121655
David Wallon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178526
- IdHAL : davidwallon
- ORCID : 0000-0002-2634-7198
- IdRef : 157825809
Céline Bellenguez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1253558
- IdHAL : celine-bellenguez
Stéphane Rousseau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178973
- IdHAL : laure-guilhaudis
- ORCID : 0000-0002-6212-9593
- IdRef : 230659403
Anne Rovelet-Lecrux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178525
- IdHAL : anne-rovelet-lecrux
- ORCID : 0000-0003-4454-3659
- IdRef : 127676732
Delphine Bacq
- Fonction : Auteur
Robert Olaso
- Fonction : Auteur
- PersonId : 774936
- ORCID : 0000-0001-7631-9657
Anne Boland
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757786
- ORCID : 0000-0001-8789-5676
Philippe Amouyel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756626
- ORCID : 0000-0001-9088-234X
- IdRef : 058556818
Mark Lathrop
- Fonction : Auteur
Thierry Frebourg
- Fonction : Auteur
Richard Redon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758188
- ORCID : 0000-0001-7751-2280
- IdRef : 069236984
Luc Letenneur
- Fonction : Auteur
Jean-François Dartigues
- Fonction : Auteur
Florence Pasquier
- Fonction : Auteur
Adeline Rollin-Sillaire
- Fonction : Auteur
Emmanuelle Génin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 181372
- IdHAL : emmanuelle-genin
- ORCID : 0000-0003-4117-2813
- IdRef : 114211302
Jean-Charles Lambert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757776
- ORCID : 0000-0003-0829-7817
- IdRef : 12491506X
Didier Hannequin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 842408
Dominique Campion
- Fonction : Auteur
- PersonId : 863253
Olivier Godefroy
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 901333
- ORCID : 0000-0001-6789-6620
- IdRef : 068994737
Résumé
OBJECTIVE: To study the association between ABCA7 rare coding variants and Alzheimer disease (AD) in a case-control setting. METHODS: We conducted a whole exome analysis among 484 French patients with early-onset AD and 590 ethnically matched controls. RESULTS: After collapsing rare variants (minor allele frequency ≤1%), we detected an enrichment of ABCA7 loss of function (LOF) and predicted damaging missense variants in cases (odds ratio [OR] 3.40, 95% confidence interval [CI] 1.68-7.35, p = 0.0002). Performing a meta-analysis with previously published data, we found that in a combined sample of 1,256 patients and 1,347 controls from France and Belgium, the OR was 2.81 (95% CI 1.89-4.20, p = 3.60 × 10(-7)). CONCLUSIONS: These results confirm that ABCA7 LOF variants are enriched in patients with AD and extend this finding to predicted damaging missense variants.