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Conference papers

Modélisation des dépendances locales entre SNP à l'aide d'un réseau bayésien

Résumé : Dans le cadre d'une étude sur une maladie génétique commune, la dystrophie valvulaire, nous cherchons à modéliser le déséquilibre de liaison existant entre les SNP proches sur l'ADN. Les modèles graphiques probabilistes apparaissent comme des outils intéressants pour une modélisation fine et biologiquement pertinente des dépendances existantes entre les SNP tant au niveau haplotypique que génotypique. La connaissance des haploblocs sur l'ADN nous permet de rendre compte en partie du déséquilibre de liaison présent localement. Cependant, nous montrons que les dépendances entre SNP appartenant à des haploblocs différents sont aussi présentes. A l'aide des réseaux bayésiens incorporant la connaissance des haploblocs sur l'ADN, nous proposons une méthode de modélisation de l'ensemble des dépendances locales du génome.
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00423461
Contributor : Christine Sinoquet <>
Submitted on : Saturday, October 10, 2009 - 5:30:25 PM
Last modification on : Thursday, January 17, 2019 - 10:40:04 AM

Identifiers

  • HAL Id : hal-00423461, version 1

Collections

Citation

Raphaël Mourad, Christine Sinoquet, Philippe Leray. Modélisation des dépendances locales entre SNP à l'aide d'un réseau bayésien. Proc. SFC'09, XVIth Join Meeting of the French Society of Classification, actes des 16èmes rencontres de la Société Francophone de Classification, Sep 2009, Grenoble, France. pp.169-172. ⟨hal-00423461⟩

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