Simulation of the covid19 epidemic in France

Simulation de l'épidémie de covid19 en france

Loïc Pottier (1)

1 HDR, enseignant en CPGE

We simulate the evolution of the covid19 epidemic in France on a computer. With approximately 10,000 simulations performed with random epidemic parameters, we obtain a value of the basic reproductive number R0 = 7.5 with a confidence interval (CrI) 6.4-8.6 (for the standard deviation). For the mortality rate (infection fatality ratio), we get IFR = 3.1% (CrI: 1.6-4.7). 2 During the social distancing period (March 9-March 16), we get R0 = 2.14. For the lockdown period, which started on March 17, we obtain R0 = 0.88 (CrI: 0.74-1.02). We can conclude that lockdown will not stop the epidemic, and that releasing it will cause a new outbreak. With these values, the simulations carried out give a number of infected persons of approximately 650,000 currently (1% of the population) and predict limits of 1 million infected persons (1.6% of the population) and 30 000 deaths, limits reached in about 1 year, and almost reached in about 5 months. Every day we make new simulations using daily datas, and new results are sumarized here: https://cp.lpmib.fr/medias/covid19/synthesis_last.html. The code is available here: https://github.com/loicpottier/covid19

Nous simulons l'évolution de l'épidémie de covid19 en France sur ordinateur. Avec environ 10 000 simulations effectuées avec des paramètres épidémiques aléatoires, nous obtenons une valeur du nombre de reproduction de base R0 = 7,5 avec un intervalle de confiance (CrI) 6,4-8,6 (pour l'écart-type). Pour le taux de mortalité (infection fatality ratio), nous obtenons IFR = 3,1% (CrI: 1,6-4,7). Pendant la période de distanciation sociale (9 mars - 16 mars), nous obtenons R0 = 2,14. Pour la période de confinement, qui a commencé le 17 mars, nous obtenons R0 = 0,88 (CrI: 0,74-1,02). Nous pouvons conclure que le confinement ne mettra pas fin à l'épidémie et que son arrêt entraînera une nouvelle flambée. Avec ces valeurs, les simulations effectuées donnent un nombre de personnes infectées d'environ 650 000 actuellement (1% de la population) et prévoient des limites de 1 million de personnes infectées (1,6% de la population) et 30 000 décès, limites atteintes dans environ 1 année, et presque atteintes dans environ 5 mois.Chaque jour, nous faisons de nouvelles simulations en utilisant les données quotidiennes, et les résultats sont résumés ici: https://cp.lpmib.fr/medias/covid19/synthesis_last.html. Le code est disponible ici: https://github.com/loicpottier/covid19

Domaines: Santé publique et épidémiologie; Bio-informatique [q-bio.QM]

Loïc Pottier. Simulation of the covid19 epidemic in France. 2020. ⟨hal-02555718v1⟩