Gene alterations in epigenetic modifiers and JAK-STAT signaling are frequent in breast implant-associated ALCL.
Camille Laurent
(1)
,
Alina Nicolae
,
Cecile Laurent
(2)
,
Fabien Le Bras
(3)
,
Corinne Haioun
(4)
,
Virginie Fataccioli
(5)
,
Nadia Amara
(6)
,
José Adelaïde
(7)
,
Arnaud Guille
(7)
,
Jean-Marc Schiano
(8)
,
Bruno Tesson
(9)
,
Alexandra Traverse-Glehen
(10)
,
Marie-Pierre Chenard
(11)
,
Lénaïg Mescam
,
Anne Moreau
(12)
,
Catherine Chassagne-Clément
(13)
,
Joan Somja
,
Marc Andre
(14)
,
Nadine Martin
(15)
,
Laetitia Lacroix
(16)
,
François A. Lemonnier
(5)
,
Anne-Sophie Hamy
(17)
,
Fabien Reyal
(18)
,
Marie Bannier
(8)
,
Lucie Obéric
(19)
,
Nais Prade
(19)
,
François-Xavier Frénois
,
Asma Beldi-Ferchiou
(20)
,
Marie-Hélène Delfau-Larue
(5)
,
Réda Bouabdallah
(21)
,
Daniel Birnbaum
(7)
,
Pierre Brousset
(22)
,
Luc Xerri
(8)
,
Philippe Gaulard
(5)
,
Frédéric Escudie
(23)
1
LJLL -
Laboratoire Jacques-Louis Lions
2 Rt2 Lab
3 CHU Henri Mondor [Créteil]
4 Service d'hématologie clinique
5 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
6 IUG - IU Gaza - Islamic University of Gaza
7 CRCM - Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille
8 IPC - Institut Paoli-Calmettes
9 CALYM - Institut Carnot Lymphome
10 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
11 Service d'Anatomie Pathologique Générale
12 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes
13 Département d'anatomopathologie, biopathologie
14 GRHis - Groupe de Recherche d'Histoire
15 CEPHAG - Centre d'Études des Phénomènes Aléatoires et Géophysiques
16 CRC (UMR_S_1138 / U1138) - Centre de Recherche des Cordeliers
17 Centre des maladies du sein
18 Surgery Department
19 Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse]
20 Hôpital Henri Mondor
21 Service d'Hématologie
22 CRCT - Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse
23 IUCT Oncopole - UMR 1037 - Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole
2 Rt2 Lab
3 CHU Henri Mondor [Créteil]
4 Service d'hématologie clinique
5 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
6 IUG - IU Gaza - Islamic University of Gaza
7 CRCM - Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille
8 IPC - Institut Paoli-Calmettes
9 CALYM - Institut Carnot Lymphome
10 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
11 Service d'Anatomie Pathologique Générale
12 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes
13 Département d'anatomopathologie, biopathologie
14 GRHis - Groupe de Recherche d'Histoire
15 CEPHAG - Centre d'Études des Phénomènes Aléatoires et Géophysiques
16 CRC (UMR_S_1138 / U1138) - Centre de Recherche des Cordeliers
17 Centre des maladies du sein
18 Surgery Department
19 Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse]
20 Hôpital Henri Mondor
21 Service d'Hématologie
22 CRCT - Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse
23 IUCT Oncopole - UMR 1037 - Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole
Camille Laurent
- Fonction : Auteur
- PersonId : 7253
- IdHAL : camille-laurent-gengoux
- ORCID : 0000-0002-9363-869X
- IdRef : 070666768
Alina Nicolae
- Fonction : Auteur
Jean-Marc Schiano
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791500
- ORCID : 0000-0001-9923-4808
Lénaïg Mescam
- Fonction : Auteur
Joan Somja
- Fonction : Auteur
Nadine Martin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 773450
- ORCID : 0000-0002-4806-2388
Nais Prade
- Fonction : Auteur
- PersonId : 814303
- ORCID : 0000-0003-4718-7848
François-Xavier Frénois
- Fonction : Auteur
Asma Beldi-Ferchiou
- Fonction : Auteur
- PersonId : 777092
- ORCID : 0000-0002-7806-9687
Daniel Birnbaum
- Fonction : Auteur
- PersonId : 834190
Pierre Brousset
- Fonction : Auteur
- PersonId : 759012
- ORCID : 0000-0002-8629-3291
Frédéric Escudie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1067559
Résumé
The oncogenic events involved in breast implant-associated anaplastic large cell lymphoma (BI-ALCL) remain elusive. To clarify this point, we have characterized the genomic landscape of 34 BI-ALCLs (15 tumor and 19 in situ subtypes) collected from 54 BI-ALCL patients diagnosed through the French Lymphopath network. Whole-exome sequencing (n = 22, with paired tumor/germline DNA) and/or targeted deep sequencing (n = 24) showed recurrent mutations of epigenetic modifiers in 74% of cases, involving notably KMT2C (26%), KMT2D (9%), CHD2 (15%), and CREBBP (15%). KMT2D and KMT2C mutations correlated with a loss of H3K4 mono- and trimethylation by immunohistochemistry. Twenty cases (59%) showed mutations in ≥1 member of the JAK/STAT pathway, including STAT3 (38%), JAK1 (18%), and STAT5B (3%), and in negative regulators, including SOCS3 (6%), SOCS1 (3%), and PTPN1 (3%). These mutations were more frequent in tumor-type samples than in situ samples (P = .038). All BI-ALCLs expressed pSTAT3, regardless of the mutational status of genes in the JAK/STAT pathway. Mutations in the EOMES gene (12%) involved in lymphocyte development, PI3K-AKT/mTOR (6%), and loss-of-function mutations in TP53 (12%) were also identified. Copy-number aberration (CNA) analysis identified recurrent alterations, including gains on chromosomes 2, 9p, 12p, and 21 and losses on 4q, 8p, 15, 16, and 20. Regions of CNA encompassed genes involved in the JAK/STAT pathway and epigenetic regulators. Our results show that the BI-ALCL genomic landscape is characterized by not only JAK/STAT activating mutations but also loss-of-function alterations of epigenetic modifiers.