WIsH: who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs

Clovis Galiez (1) , Matthias Siebert , Francois Enault (2) , Jonathan Vincent (3) , Johannes Söding (4) , Inanc Birol (5)

1 Grenoble INP - Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology
2 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
3 GDEC - Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales
4 MVP - Max Von Pettenkofer Institute
5 BCCRC - BC Cancer Agency

Domaines: Intelligence artificielle [cs.AI]; Apprentissage [cs.LG]; Sciences de l'environnement; Biodiversité et Ecologie; Milieux et Changements globaux; Sciences du Vivant [q-bio]; Génétique; Génétique des populations [q-bio.PE]; Protistologie; Bactériologie

Clovis Galiez, Matthias Siebert, Francois Enault, Jonathan Vincent, Johannes Söding, et al.. WIsH: who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs. Bioinformatics, 2017, 33 (19), pp.3113-3114. ⟨10.1093/bioinformatics/btx383⟩. ⟨hal-02088265⟩