Large Scale Explorative Oligonucleotide Probe Selection for Thousands of Genetic Groups on a Computing Grid: Application to Phylogenetic Probe Design Using a Curated Small Subunit Ribosomal RNA Gene Database

Faouzi Jaziri (1, 2) , Eric Peyretaillade (3) , Mohieddine Missaoui (1) , Nicolas Parisot (2) , Sébastien Cipière (4) , Jérémie Denonfoux (2) , Antoine Mahul (5) , Pierre Peyret (3) , David R.C. Hill

1 LIMOS - Laboratoire d'Informatique, de Modélisation et d'optimisation des Systèmes
2 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
3 CIDAM - Conception, Ingénierie et Développement de l'Aliment et du Médicament
4 LPC - Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand
5 Clermont Université

Domaines: Sciences du Vivant [q-bio]; Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]

Faouzi Jaziri, Eric Peyretaillade, Mohieddine Missaoui, Nicolas Parisot, Sébastien Cipière, et al.. Large Scale Explorative Oligonucleotide Probe Selection for Thousands of Genetic Groups on a Computing Grid: Application to Phylogenetic Probe Design Using a Curated Small Subunit Ribosomal RNA Gene Database. TheScientificWorldJournal, 2014, 2014, pp.24516366. ⟨10.1155/2014/350487⟩. ⟨hal-01110169v1⟩