Un noyau sur graphe prenant en compte la stéréoisomérie des molécules

Pierre-Anthony Grenier (1) , Luc Brun (1) , Didier Villemin (2)

1 Equipe Image - Laboratoire GREYC - UMR6072
2 LCMT - Laboratoire de chimie moléculaire et thioorganique

L'étude des relations quantitatives structure-activité (QSAR) ou structure-propriété (QSPR) sont deux domaines de recherche actifs, où le but est la prédiction de propriétés de molécules. Dans ces domaines, les noyaux sur graphes permettent de combiner la représentation naturelle des molécules par des graphes avec des méthodes classiques d'apprentissage automatique tels que les machines à vecteurs de support. Malheureusement, le positionnement relatif des atomes dans l'espace peut être différent pour des molécules représentées par un même graphe, ces molécules peuvent donc avoir des propriétés différentes. Ces molécules sont appelées stéréoisomères. Les propriétés variant entre les stéréoisomères ne peuvent pas être prédites par les méthodes habituelles basées sur des graphes simples. Dans cet article, nous présentons une nouvelle représentation des molécules qui prend en compte la stéréoisomérie et nous proposons un noyau entre ces structures permettant de prédire des propriétés liées à la stéréoisomérie.

Mots clés: Noyau sur graphe; chémoinformatique; stéréoisomérie

Domaines: Vision par ordinateur et reconnaissance de formes [cs.CV]

Pierre-Anthony Grenier, Luc Brun, Didier Villemin. Un noyau sur graphe prenant en compte la stéréoisomérie des molécules. Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France. ⟨hal-00988762⟩