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Conference papers
Méthodologie Pour Comparer Différentes Méthodes D'extraction De Biomarqueurs Sans Méthode De Référence. Application À La Segmentation Du Ventricule Gauche En Irm Cardiaque Pour Estimer La Fraction D'éjection.
Frédérique Frouin
1
Mireille Garreau
2
Irène Buvat
3
Christopher Casta
4
Constantin Constantinidès
5, 1
Jean Cousty
6
Alexandre Cochet
Stéphanie Jehan-Besson
7
Christophe Tilmant
8
Murielle Lefort
1
Laurent Najman
6
Laurent Sarry
9, 10
P. Clarysse
A. de Cesare
A. Lalande
11
4
MOTIVATE - Imagerie et modélisation Vasculaires, Thoraciques et Cérébrales
CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé : 139739
7
Equipe Image - Laboratoire GREYC - UMR6072
GREYC - Groupe de Recherche en Informatique, Image, Automatique et Instrumentation de Caen
Frédérique Frouin 1
Author IdHAL : frederique-frouin ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/N-7709-2015 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7288-1543
Mireille Garreau 2
Author
Irène Buvat 3
Author IdHAL : irene-buvat ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7053-6471
Christopher Casta 4
Author
Constantin Constantinidès 5, 1
Author
Jean Cousty 6
Author IdHAL : jean-cousty ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2163-9714
Alexandre Cochet
Author
Stéphanie Jehan-Besson 7
Author IdHAL : stephanie-jehan-besson ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1850-3445
Christophe Tilmant 8
Author
Murielle Lefort 1
Author
Laurent Najman 6
Author IdHAL : laurent-najman arXiv : https://arxiv.org/a/lnajman ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6190-0235
Laurent Sarry 9, 10
Author IdHAL : laurent-sarry ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2237-0497
P. Clarysse
Author IdHAL : patrick-clarysse ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/G-6371-2014 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5495-7655
A. de Cesare
Author
A. Lalande 11
Author IdHAL : alain-lalande ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7970-366X
1
LIF - Laboratoire d'imagerie fonctionnelle [Paris] (Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière
91, boulevard de l'Hôpital
75634 - PARIS Cedex 13 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 : UMR_S 678 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
2
LTSI - Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (Campus Universitaire de Beaulieu - Bât 22 - 35042 Rennes - France)
- UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1099 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
3
IMNC (UMR_8165) - Imagerie et Modélisation en Neurobiologie et Cancérologie (Université Paris Sud - Bâtiment 440
15 rue Georges Clémenceau
91405 Orsay Cedex - France - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- IN2P3 - Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (France)
- UPD7 - Université Paris Diderot - Paris 7 : UMR_8165 (5 rue Thomas-Mann - 75205 Paris cedex 13 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR_8165 (France)
4
MOTIVATE - Imagerie et modélisation Vasculaires, Thoraciques et Cérébrales (France)
- CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé : 139739 (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
5
PRIAM - Pôle de Recherche en Ingénierie Appliquée à la Médecine (ESME Sudria 38 rue Molière 94200 IVRY SUR SEINE - France)
- ESME Sudria [Paris] ( 40-42 Rue du Dr Roux, 75015 Paris - France)
6
LIGM - Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (Université de Paris-Est Marne-la-Vallée, Cité Descartes, Bâtiment Copernic, 5 bd Descartes, 77454 Marne-la-Vallée Cedex 2 - France)
- UPEM - Université Paris-Est Marne-la-Vallée (5 boulevard Descartes - Champs-sur-Marne - 77454 Marne-la-Vallée Cedex 2 - France)
- ENPC - École des Ponts ParisTech (École des Ponts ParisTech 6-8 avenue Blaise-Pascal Cité Descartes 77455 Champs-sur-Marne Marne-la-Vallée cedex 2 - France)
- ESIEE Paris (2 boulevard Blaise Pascal Cité Descartes BP 99 93162 Noisy-le-Grand Cedex - France)
- Fédération de Recherche Bézout (France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8049 (France)
7
Equipe Image - Laboratoire GREYC - UMR6072 (France)
- GREYC - Groupe de Recherche en Informatique, Image, Automatique et Instrumentation de Caen (Boulevard du Maréchal Juin - 14050 CAEN Cedex - France)
- UNICAEN - Université de Caen Normandie (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 CAEN Cedex 5 - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- ENSICAEN - École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (6, Boulevard du Maréchal Juin CS 45053 14050 CAEN cedex 04 - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6072 (France)
- UNICAEN - Université de Caen Normandie (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 CAEN Cedex 5 - France)
8
IP - Institut Pascal (Campus Universitaire des Cézeaux, 4 avenue Blaise Pascal, TSA 60026 / CS 60026, 63178 Aubière Cedex - France)
- UBP - Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 : UMR6602 (34, avenue Carnot - BP 185 / 63006 Clermont-Ferrand cedex - France)
- SIGMA Clermont - SIGMA Clermont (SIGMA Clermont / Campus des Cézeaux / CS 20265 / 63178 Aubière Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6602 (France)
9
PTEA - Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (INRA Domaine Duclos Petit-Bourg F-97170 Guadeloupe ; Domaine de Gardelle Le Moule F-97160 Guadeloupe - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UE (France)
10
Université Auvergne ERIM EA 3295 (Clermont-Ferrand - France)
- UdA - Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (49, Boulevard François-Mitterrand / CS 60032 / 63001 Clermont-Ferrand Cedex 1 - France)
11
LCPTS - Laboratoire de Communication Parlée et traitement du Signal (Batiment Electronique, Faculté d'Electronique et Informatique, USTHB, B.P. 32, El-Alia, Bab-Ezzouar 16111, Alger - Algeria)
- USTHB - Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene [Alger] (BP 32 EL Alia 16111 Bab Ezzouar, Alger - Algeria)
Résumé : Une méthodologie est proposée pour comparer plusieurs méthodes d’estimation d’un paramètre d’intérêt clinique sans connaître de gold standard. Elle est appliquée à un problème de comparaison de la fraction d’éjection du ventricule gauche en IRM cardiaque obtenue par sept approches de segmentation différentes et appliquée à 30 examens issus de la base de données constituée pour le challenge Miccai 2009 de segmentation du ventricule gauche. La comparaison des méthodes montre une supériorité du tracé manuel, un bon comportement des méthodes de segmentation semi-automatiques et un plus mauvais comportement des méthodes plus largement automatisées. La méthodologie de comparaison proposée qui ne fait aucun a priori sur les méthodes retrouve ainsi l’ordre attendu. Cette approche méthodologique est donc pertinente et doit permettre une classification non supervisée de différentes méthodes d’estimation de biomarqueurs.
Document type :
Conference papers
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00908741
Contributor : Morgane Le Corre <>
Submitted on : Tuesday, January 3, 2017 - 9:48:08 AM
Last modification on : Wednesday, April 28, 2021 - 12:04:02 PM
Long-term archiving on: : Tuesday, April 4, 2017 - 1:10:21 PM
Contributor : Morgane Le Corre <>
Submitted on : Tuesday, January 3, 2017 - 9:48:08 AM
Last modification on : Wednesday, April 28, 2021 - 12:04:02 PM
Long-term archiving on: : Tuesday, April 4, 2017 - 1:10:21 PM
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RITS2011.pdf
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- HAL Id : hal-00908741, version 1
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Citation
Frédérique Frouin, Mireille Garreau, Irène Buvat, Christopher Casta, Constantin Constantinidès, et al.. Méthodologie Pour Comparer Différentes Méthodes D'extraction De Biomarqueurs Sans Méthode De Référence. Application À La Segmentation Du Ventricule Gauche En Irm Cardiaque Pour Estimer La Fraction D'éjection.. RITS 2011 (Colloque National Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé), Apr 2011, Rennes (CHU), France. ⟨hal-00908741⟩
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