RNAcentral: A vision for an international database of RNA sequences. - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue RNA Année : 2011

RNAcentral: A vision for an international database of RNA sequences.

Alex Bateman
  • Fonction : Auteur
Shipra Agrawal
  • Fonction : Auteur
Ewan Birney
  • Fonction : Auteur
Elspeth A Bruford
  • Fonction : Auteur
Janusz M Bujnicki
  • Fonction : Auteur
Guy Cochrane
  • Fonction : Auteur
James R Cole
  • Fonction : Auteur
Marcel E Dinger
  • Fonction : Auteur
Anton J Enright
  • Fonction : Auteur
Paul P Gardner
  • Fonction : Auteur
Sam Griffiths-Jones
  • Fonction : Auteur
Jen Harrow
  • Fonction : Auteur
Javier Herrero
  • Fonction : Auteur
Ian H Holmes
  • Fonction : Auteur
Hsien-Da Huang
  • Fonction : Auteur
Krystyna A Kelly
  • Fonction : Auteur
Paul Kersey
  • Fonction : Auteur
Ana Kozomara
  • Fonction : Auteur
Todd M Lowe
  • Fonction : Auteur
Manja Marz
  • Fonction : Auteur
Simon Moxon
  • Fonction : Auteur
Kim D Pruitt
  • Fonction : Auteur
Tore Samuelsson
  • Fonction : Auteur
Peter F Stadler
  • Fonction : Auteur
Albert J Vilella
  • Fonction : Auteur
Jan-Hinnerk Vogel
  • Fonction : Auteur
Kelly P Williams
  • Fonction : Auteur
Mathew W Wright
  • Fonction : Auteur
Christian Zwieb
  • Fonction : Auteur

Résumé

During the last decade there has been a great increase in the number of noncoding RNA genes identified, including new classes such as microRNAs and piRNAs. There is also a large growth in the amount of experimental characterization of these RNA components. Despite this growth in information, it is still difficult for researchers to access RNA data, because key data resources for noncoding RNAs have not yet been created. The most pressing omission is the lack of a comprehensive RNA sequence database, much like UniProt, which provides a comprehensive set of protein knowledge. In this article we propose the creation of a new open public resource that we term RNAcentral, which will contain a comprehensive collection of RNA sequences and fill an important gap in the provision of biomedical databases. We envision RNA researchers from all over the world joining a federated RNAcentral network, contributing specialized knowledge and databases. RNAcentral would centralize key data that are currently held across a variety of databases, allowing researchers instant access to a single, unified resource. This resource would facilitate the next generation of RNA research and help drive further discoveries, including those that improve food production and human and animal health. We encourage additional RNA database resources and research groups to join this effort. We aim to obtain international network funding to further this endeavor.

Dates et versions

hal-00639172 , version 1 (08-11-2011)

Identifiants

Citer

Alex Bateman, Shipra Agrawal, Ewan Birney, Elspeth A Bruford, Janusz M Bujnicki, et al.. RNAcentral: A vision for an international database of RNA sequences.. RNA, 2011, 17 (11), pp.1941-6. ⟨10.1261/rna.2750811⟩. ⟨hal-00639172⟩
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