Occurrence probability of structured motifs in random sequences

S. Robin; J.J. Daudin; H. Richard; M.-F. Sagot; S. Schbath

doi:10.1089/10665270260518254

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Occurrence probability of structured motifs in random sequences

S. Robin J.J. Daudin H. Richard M.-F. Sagot ¹ S. Schbath ²

1 Baobab

PEGASE - Département PEGASE [LBBE]

2 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558

S. Robin AuthorId : 1660339
Author IdHAL : scjrobin arXiv : https://arxiv.org/a/srobin ORCID : https://orcid.org/0000-0003-1045-069X

J.J. Daudin AuthorId : 410282
Author

H. Richard AuthorId : 95097
Author

M.-F. Sagot ¹ AuthorId : 322950
Author IdHAL : marie-france-sagot

S. Schbath ² AuthorId : 441938
Author

1 Baobab (LBBE 43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 543494

PEGASE - Département PEGASE [LBBE] (LBBE 43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 543488
- LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 10025
  - UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
    - Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France) StructId : 301767
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France) StructId : 441569

2 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 10025

UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France) StructId : 301767
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France) StructId : 441569

Keywords : MOTIF OCCURRENCES MARKOV MODELS PROMOTERS STRUCTURED MOTIFS

Document type :

Journal articles

Domain :

Life Sciences [q-bio] / Other [q-bio.OT]

Complete list of metadata

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00427461
Contributor : Stéphane Delmotte Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, October 28, 2009 - 5:03:17 PM
Last modification on : Tuesday, July 20, 2021 - 5:20:05 PM

Identifiers

HAL Id : hal-00427461, version 1
DOI : 10.1089/10665270260518254

Collections

CNRS | INRIA | BIOENVIS | UNIV-LYON1 | UDL

Citation

S. Robin, J.J. Daudin, H. Richard, M.-F. Sagot, S. Schbath. Occurrence probability of structured motifs in random sequences. Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2002, 9 (6), pp.761-773. ⟨10.1089/10665270260518254⟩. ⟨hal-00427461⟩

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