Inferring regulatory elements from a whole genome. An application to the analysis of the genome of Helicobacter pylori sigma 80 family of promoter signals

A. Vanet; L. Marsan; A. Labigne; M.-F. Sagot

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Inferring regulatory elements from a whole genome. An application to the analysis of the genome of Helicobacter pylori sigma 80 family of promoter signals

A. Vanet ¹ L. Marsan A. Labigne M.-F. Sagot ²

1 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558

2 Baobab

PEGASE - Département PEGASE [LBBE]

A. Vanet ¹
Author
PersonId : 716
IdHAL : anne-vanetIdRef : 250396904

L. Marsan
Author

A. Labigne
Author

M.-F. Sagot ²
Author
PersonId : 170068
IdHAL : marie-france-sagotIdRef : 103537562

1 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 10025

UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France) StructId : 301767
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France) StructId : 441569

2 Baobab (LBBE 43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 543494

PEGASE - Département PEGASE [LBBE] (LBBE 43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 543488
- LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France) StructId : 10025
  - UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
    - Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France) StructId : 301767
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France) StructId : 441569

Document type :

Journal articles

Domain :

Life Sciences [q-bio] / Other [q-bio.OT]

Complete list of metadata

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00427110
Contributor : Stéphane Delmotte Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, October 28, 2009 - 4:47:36 PM
Last modification on : Tuesday, July 20, 2021 - 5:20:05 PM

Identifiers

HAL Id : hal-00427110, version 1

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CNRS | INRIA | UNIV-LYON1 | BIOENVIS | UDL

Citation

A. Vanet, L. Marsan, A. Labigne, M.-F. Sagot. Inferring regulatory elements from a whole genome. An application to the analysis of the genome of Helicobacter pylori sigma 80 family of promoter signals. Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2000, 297, pp.335-353. ⟨hal-00427110⟩

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