La taille efficace d’un nématode phytoparasite chez son hôte sauvage
Résumé
La taille efficace est un paramètre essentiel en génétique des populations, puisqu'il reflète l'impact de la dérive sur la diversité génétique. En agronomie, elle joue un rôle déterminant dans l’efficacité de la lutte génétique : les résistances déployées exercent de fortes pressions de sélection sur les parasites visés et risquent d’être contournées si les tailles efficaces sont suffisamment importantes. L'objectif de cette étude est de déterminer la taille efficace de populations d' [i]Heterodera schachtii[/i] , un nématode parasite de la betterave. Pour l’évaluer, nous avons utilisé la variation temporelle des fréquences alléliques de 8 locus microsatellites à partir de deux prélèvements successifs, réalisés à un an d’intervalle, dans le milieu sauvage, où l’enchaînement des générations n'est pas interrompu par les successions culturales. Le nombre de génération produit par [i]Heterodera schachtii[/i] entre les deux périodes d’échantillonnage a été estimé entre 4 et 10, et nous avons donc effectué les calculs de taille efficace pour un écart supposé de 4, 7 et 10 générations, 7 étant la plus réaliste. Un nombre non négligeable de nos populations présentaient des tailles efficaces infinies, ce qui est le signe d'une absence de variation. Nous avons pu associer ce résultat à une production trop faible de nouvelles générations pour ces populations, probablement liée à la mort des plantes parasitées. Les autres populations présentaient des tailles efficaces finies comprises entre 20 et 300 individus, avec une distribution centrée autour de 74. Cette valeur est très faible par rapport au nombre potentiel d'individus dans les populations. Cette faiblesse peut être reliée à la forte consanguinité observée dans ces populations et aux importantes fluctuations d'effectifs. Les niveaux de consanguinité sont équivalents et les fluctuations d'effectifs plus fortes en milieu cultivé, mais ce milieu est aussi caractérisé par des flux de gènes, notamment d'origine anthropiques, plus importants. Nous discuterons des implications de ces résultats pour la durabilité des résistances utilisées pour la lutte génétique.