What can nuclear microsatellites tell us about maritime pine genetic resources conservation and provenance certification strategies?

Jérémy Derory , Stéphanie Mariette , Santiago Gonzaléz-Martínez , David Chagné , Delphine Madura , Sophie Gerber , Jean Brach , François Persyn , Maria Ribeiro , Christophe Plomion

Maritime pine (Pinus pinaster Ait.) is the first conifer used for reforestation in France and now covers 2.4 million ha of the Iberian Peninsula. In order to preserve the genetic resources of this economically and ecologically important species prior knowledge of the distribution of genetic diversity is needed. In this paper, a genetic diversity study was performed using nuclear simple sequence repeats (SSRs or microsatellites). Classical parameters of diversity (allelic richness and heterozygosity) and differentiation were estimated for 47 populations of P. pinaster. Most of the populations (40) were collected in France, six populations were also collected in the Iberian Peninsula and one Moroccan population was also included in the study. The population genetic parameters indicated that some populations should be a focus of conservation efforts (higher level of diversity, higher allelic richness and presence of rare alleles). A diagnostic test for sample origin was developed to distinguish Corsican from Landes populations.

Que nous indiquent les microsatellites nucléaires sur la conservation des ressources génétiques du pin maritime et sur les stratégies de certification de provenances ? Le pin maritime (Pinus pinaster Ait.) est le premier conifère utilisé pour le reboisement en France et couvre environ 2,4 millions d'hectares dans la péninsule Ibérique. Dans le but de conserver les ressources génétiques de cette espèce, importante du point de vue économique et écologique, une connaissance préalable de la distribution de sa diversité génétique est nécessaire. Dans ce papier, une étude de diversité génétique a été menée en utilisant des marqueurs microsatellites. Les paramètres classiques de diversité (richesse allélique et hétérozygotie) et de différenciation ont été calculés au sein de 47 populations. La plupart des populations (40) ont été échantillonnées en France, six populations ont été choisies dans la Péninsule Ibérique et une population marocaine a également été incluse dans l'analyse. Les résultats de génétique des populations montrent que certaines populations pourraient être intéressantes pour la conservation des ressources génétiques de l'espèce (niveau d'hétérozygotie ou de richesse allélique plus élevée que les autres populations, présence d'allèles rares). Nous avons montré que les résultats de cette analyse fournissent un test diagnostic pour distinguer les populations d'origine landaise des populations d'origine corse.

Mots clés: genetic diversity; nuclear microsatellites; provenance identification<br>---<br>Pinus pinaster; microsatellites nucléaires; diversité génétique; conservation; certification de provenance

Domaines: Sylviculture, foresterie

Jérémy Derory, Stéphanie Mariette, Santiago Gonzaléz-Martínez, David Chagné, Delphine Madura, et al.. What can nuclear microsatellites tell us about maritime pine genetic resources conservation and provenance certification strategies?. Annals of Forest Science, 2002, 59 (5-6), pp.699-708. ⟨10.1051/forest:2002058⟩. ⟨hal-00881936⟩