Construction automatique d'ontologie à partir de bases de données relationnelles : application au médicament dans le domaine de la pharmacovigilance

Sonia Krivine (1) , Jérôme Nobécourt (1) , Lina Soualmia (1) , Farid Cerbah (2) , Catherine Duclos (1)

1 LIM&BIO - Laboratoire d'Informatique Médicale et de BIOinformatique
2 Département des Etudes Scientifiques

Afin de construire une ontologie des médicaments en OWL dans le cadre d'un projet sur la pharmacovigilance, nous envisageons la possibilité de réutiliser les connaissances contenues dans une base de données. L'étude des outils permettant cette transition montre qu'ils ne sont pas entièrement satisfaisants. En effet, ils ne considèrent pas chaque enregistrement comme étant un concept et de ce fait les hiérarchies implicites contenues dans la base ne sont pas restituées. Nous proposons une extension de l'outil RDBToOnto afin d'empêcher l'instanciation des enregistrements de certaines tables de la base et de reproduire les hiérarchies de concepts.

Mots clés: Ontologies; bases de données relationnelles; pharmacovigilance; médicament

Domaines: Intelligence artificielle [cs.AI]; Informatique; Autre [cs.OH]

Sonia Krivine, Jérôme Nobécourt, Lina Soualmia, Farid Cerbah, Catherine Duclos. Construction automatique d'ontologie à partir de bases de données relationnelles : application au médicament dans le domaine de la pharmacovigilance. IC 2009, May 2009, Tunisie. pp. ⟨hal-00377455⟩