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VchM - a DNA cytosine methyltransferase modulates the response of Vibrio cholerae to proteotoxic stress

 André Carvalho
Molecular biology. Sorbonne Université, 2021. English. ⟨NNT : 2021SORUS080⟩
Thèse tel-03521003v1
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Engineered toxin–intein antimicrobials can selectively target and kill antibiotic-resistant bacteria in mixed populations

 Rocío López-Igual , Joaquin Bernal-Bayard , Alfonso Rodríguez-Patón , Jean-Marc Ghigo , Didier Mazel
Nature Biotechnology, 2019, 37 (7), pp.755-760. ⟨10.1038/s41587-019-0105-3⟩
Article dans une revue pasteur-02558499v1
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Bacterial Route Finding and Collective Escape in Mazes and Fractals

 Trung Phan , Ryan Morris , Matthew Black , Tuan Do , Ke-Chih Lin , et al.
Physical Review X, 2020, 10 (3), ⟨10.1103/PhysRevX.10.031017⟩
Article dans une revue pasteur-03242799v1
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Management of multipartite genomes: the Vibrio cholerae model.

 Marie-Eve Val , Alfonso Soler-Bistué , Michael J Bland , Didier Mazel
Current Opinion in Microbiology, 2014, 22, pp.120-6. ⟨10.1016/j.mib.2014.10.003⟩
Article dans une revue pasteur-01163283v1
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Etude du système de résolution des dimères de chromosome chez Vibrio cholerae - Implication dans le contrôle de la lysogénie du phage CTXφ codant pour la toxine cholérique

 Marie-Eve Val
Biochimie, Biologie Moléculaire. Paris-Sud XI, 2008. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-01285537v1
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The emergence of Vibrio pathogens in Europe: ecology, evolution, and pathogenesis (Paris, 11-12th March 2015).

 Frédérique Le Roux , K Mathias Wegner , Craig Baker-Austin , Luigi Vezzulli , Carlos R Osorio , et al.
Frontiers in Microbiology, 2015, 6, pp.830. ⟨10.3389/fmicb.2015.00830⟩
Article dans une revue hal-01464526v1
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Étude du mécanisme de synchronisation de la réplication des deux chromosomes de Vibrio cholerae

 Théophile Niault
Biochimie [q-bio.BM]. Sorbonne Université, 2023. Français. ⟨NNT : 2023SORUS121⟩
Thèse tel-04142724v1
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Les antibiotiques induisent la capture de gènes de résistance par les bactéries

 Emilie Guérin , Guillaume Cambray , Sandra da Re , Didier Mazel , Marie-Cécile Ploy
Médecine/Sciences, 2010, 26 (1), pp.28-30. ⟨10.1051/medsci/201026128⟩
Article dans une revue hal-01413566v1

Integron Identification in Bacterial Genomes and Cassette Recombination Assays

 Claire Vit , Céline Loot , José Antonio Escudero , Aleksandra Nivina , Didier Mazel
Fernando de la Cruz. Horizontal Gene Transfer : methods and protocols, 2075, Springer, pp.189-208, 2019, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-9877-7 (online ISBN). ⟨10.1007/978-1-4939-9877-7_14⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02346783v1
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VIBRIO 2014 meeting report

 Didier Mazel , Rita Colwell , Karl Klose , James Oliver , Mags Crumlish , et al.
Research in Microbiology, 2014, 165 (10), pp.857-864. ⟨10.1016/j.resmic.2014.10.009⟩
Article dans une revue pasteur-01698403v1
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Expansion of the SOS regulon of Vibrio cholerae through extensive transcriptome analysis and experimental validation

 Evelyne Krin , Sebastian Aguilar Pierlé , Odile Sismeiro , Bernd Jagla , Marie-Agnès Dillies , et al.
BMC Genomics, 2018, 19 (1), pp.373. ⟨10.1186/s12864-018-4716-8⟩
Article dans une revue pasteur-02562431v1
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A single regulatory gene is sufficient to alter Vibrio aestuarianus pathogenicity in oysters

 David Goudenège , Marie Agnès Travers , Astrid Lemire , Philippe Haffner , Yannick Labreuche , et al.
Environmental Microbiology, 2015, 17 (11), pp.4189-4199. ⟨10.1111/1462-2920.12699⟩
Article dans une revue hal-01444897v1
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Replication termination without a replication fork trap

 Elisa Galli , Jean-Luc Ferat , Jean-Michel Desfontaines , Marie-Eve Val , Ole Skovgaard , et al.
Scientific Reports, 2019, 9, pp.8315. ⟨10.1038/s41598-019-43795-2⟩
Article dans une revue hal-02171006v1
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Primary and promiscuous functions coexist during evolutionary innovation through whole protein domain acquisitions

 José Antonio Escudero , Aleksandra Nivina , Harry Kemble , Céline Loot , Olivier Tenaillon , et al.
eLife, 2020, 9, pp.e58061. ⟨10.7554/eLife.58061⟩
Article dans une revue hal-03084482v1
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The coordinated replication of Vibrio cholerae ’s two chromosomes required the acquisition of a unique domain by the RctB initiator

 Florian Fournes , Theophile Niault , Jakub Czarnecki , Alvise Tissier-Visconti , Didier Mazel , et al.
Nucleic Acids Research, 2021, 49 (19), pp.11119-11133. ⟨10.1093/nar/gkab903⟩
Article dans une revue hal-03500868v1
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Aminoglycoside uptake, stress, and potentiation in Gram-negative bacteria: new therapies with old molecules

 Manon Lang , André Carvalho , Zeynep Baharoglu , Didier Mazel
Microbiology and Molecular Biology Reviews, 2023, ⟨10.1128/mmbr.00036-22⟩
Article dans une revue pasteur-04334889v1
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Antibiotics as physiological stress inducers and bacterial response to the challenge

 Didier Mazel , Shahriar Mobashery
Current Opinion in Microbiology, 2012, 15 (5), pp.553-554. ⟨10.1016/j.mib.2012.09.002⟩
Article dans une revue pasteur-01699483v1
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Multiple Pathways of Genome Plasticity Leading to Development of Antibiotic Resistance

 Zeynep Baharoglu , Geneviève Garriss , Didier Mazel
Antibiotics, 2013, Antibiotic Resistance, 2 (2), pp.288-315. ⟨10.3390/antibiotics2020288⟩
Article dans une revue pasteur-01691592v1
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Influence of very short patch mismatch repair on SOS inducing lesions after aminoglycoside treatment in Escherichia coli.

 Zeynep Baharoglu , Didier Mazel
Research in Microbiology, 2014, 165 (6), pp.476-80. ⟨10.1016/j.resmic.2014.05.039⟩
Article dans une revue pasteur-01423361v1
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Differences in Integron Cassette Excision Dynamics Shape a Trade-Off between Evolvability and Genetic Capacitance

 Céline Loot , Aleksandra Nivina , Jean Cury , José Antonio Escudero , Magaly Ducos-Galand , et al.
mBio, 2017, 8 (2), pp.e02296-16. ⟨10.1128/mBio.02296-16⟩
Article dans une revue pasteur-01689524v1
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Sleeping ribosomes: bacterial signaling triggers RaiA mediated persistence to aminoglycosides

 Manon Lang , Evelyne Krin , Chloé Korlowski , Odile Sismeiro , Hugo Varet , et al.
iScience, 2021, pp.103128. ⟨10.1016/j.isci.2021.103128⟩
Article dans une revue pasteur-03349141v1

Adaptation to Global Change: A Transposable Element–Epigenetics Perspective

 Olivier REY , Etienne Danchin , Marie Mirouze , Celine Loot , Simon Blanchet
Trends in Ecology & Evolution, 2016, 31 (7), pp.514-526. ⟨10.1016/j.tree.2016.03.013⟩
Article dans une revue hal-02099870v1
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Identification of genes involved in low aminoglycoside-induced SOS response in Vibrio cholerae: a role for transcription stalling and Mfd helicase.

 Z. Baharoglu , A. Babosan , D. Mazel
Nucleic Acids Research, 2014, 42 (4), pp.2366-2379. ⟨10.1093/nar/gkt1259⟩
Article dans une revue pasteur-01423602v1
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The Proximity of Ribosomal Protein Genes to oriC Enhances Vibrio cholerae Fitness in the Absence of Multifork Replication

 Alfonso Soler-Bistué , Michaël Timmermans , Didier Mazel
mBio, 2017, 8 (1), pp.e00097-17. ⟨10.1128/mBio.00097-17⟩
Article dans une revue pasteur-01689611v1
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Real-time tracking of bacterial membrane vesicles reveals enhanced membrane traffic upon antibiotic exposure

 Julia Bos , Luis Cisneros , Didier Mazel
Science Advances , 2021, 7 (4), pp.eabd1033. ⟨10.1126/sciadv.abd1033⟩
Article dans une revue pasteur-03242762v1
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Comparative genomics of pathogenic lineages of Vibrio nigripulchritudo identifies virulence-associated traits

 David Goudenège , Yannick Labreuche , Evelyne Krin , Dominique Ansquer , Sophie Mangenot , et al.
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2013, Integrated genomics and post-genomics approaches in microbial ecology, 7 (10), pp.1985-1996. ⟨10.1038/ismej.2013.90⟩
Article dans une revue pasteur-01699814v1
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Integron cassettes integrate into bacterial genomes via widespread non-classical attG sites

 Céline Loot , Gael A Millot , Egill Richard , Eloi Littner , Claire Vit , et al.
Nature Microbiology, 2024, 9 (1), pp.228-240. ⟨10.1038/s41564-023-01548-y⟩
Article dans une revue pasteur-04384854v1
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Chromosomal Integrons are Genetically and Functionally Isolated Units of Genomes

 Paula Blanco , Filipa Trig da Roza , Laura Toribio-Celestino , Lucía García-Pastor , Niccolò Caselli , et al.
2023
Pré-publication, Document de travail pasteur-04305666v1
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Genetic drivers of chromosomal integron stability

 Egill Richard , Baptiste Darracq , Eloi Littner , Claire Vit , Clémence Whiteway , et al.
2022
Pré-publication, Document de travail pasteur-03824759v1
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Cassette recombination dynamics within chromosomal integrons are regulated by toxin-antitoxin systems

 Egill Richard , Baptiste Darracq , Eloi Littner , Claire Vit , Clémence Whiteway , et al.
Science Advances , 2024, 10 (2), pp.eadj3498. ⟨10.1126/sciadv.adj3498⟩
Article dans une revue hal-04397951v1
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