PHYLORPH - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Logiciel Année : 2010

PHYLORPH

Nicolas Feau
  • Fonction : Développement
Biodiversité, Gènes & Communautés

Résumé

PHYLORPH aims to screen fungal genomic databases (107 full genome sequences available in ver. 2.0) for single copy genes that might be easily transferable and well suited for evolutionary studies in non-model fungal species. To maximize the chance to target genes with phylogenetically informative regions, PHYLORPH displays a graphical evaluation system based on the estimation of nucleotide divergence relatively to substitution type. PHYLORPH is Windows application written in Python (ver. 2.6) controlled with a graphical interface developed with the WxPython module.

Domaines

Sylviculture, foresterie

Migration ProdInra  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.inrae.fr/hal-02818690

Soumis le : samedi 6 juin 2020-16:00:11

Dernière modification le : vendredi 9 juillet 2021-12:02:04

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02818690 , version 1 (06-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02818690 , version 1
  • PRODINRA : 255694

Métadonnées

  • version :
  • Licences : Python License 2.0
  • Langage de programmation : Python
  • Code Repository :
  • Platform/OS : Windows 7

Citer

Nicolas Feau. PHYLORPH: PHYLogenetic markers for ORPHan species. 2010. ⟨hal-02818690⟩

Exporter

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