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IAPR International Conference on Pattern Recognition, Tsukba : Japon (2012)
Graph Cut Energy Minimization in a Probabilistic Learning Framework for 3D Prostate Segmentation in MRI
Soumya Ghose 1, Jhimli Mitra 1, Arnau Oliver 2, Robert Marti 2, Xavier Llado 2, Jordi Freixenet 2, Joan C. Vilanova 2, Désiré Sidibé 1, Fabrice Mériaudeau 1
(11/11/2012)

Variations in inter-patient prostate shape, and size and imaging artifacts in magnetic resonance images (MRI) hinders automatic accurate prostate segmentation. In this paper we propose a graph cut based energy minimization of the posterior probabilities obtained in a supervised learning schema for automatic 3D segmentation of the prostate in MRI. A probabilistic classification of the prostate voxels is achieved with a probabilistic atlas and a random forest based learning framework. The posterior probabilities are combined to obtain the likelihood of a voxel being prostate. Finally, 3D graph cut based energy minimization in the stochastic space provides segmentation of the prostate. The proposed method achieves a mean Dice similarity coefficient (DSC) value of 0.91±0.04 and 95% mean Hausdorff distance (HD) of 4.69±2.62 voxels when validated with 15 prostate volumes of a public dataset in a leave-one-patient-out validation framework. The model achieves statistically significant t-test p-value<0.0001 in mean DSC and mean HD values compared to some of the works in literature.
1 :  Laboratoire Electronique, Informatique et Image (Le2i)
Université de Bourgogne – Arts et Métiers ParisTech – CNRS : UMR6306
2 :  Visio per computador i robotica (VICOROB)
Universitat de Girona
Informatique/Imagerie médicale
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ICPR2012_MRI_Soumya2.pdf(430.7 KB)

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