L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêt

Nathalie Villa-Vialaneix (1, 2) , Laurence Liaubet (3) , Thibault Laurent (4) , Adrien Gamot (5) , Pierre Cherel (6) , Magali San Cristobal (3)

1 IMT - Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219
2 UPVD - IUT - Département STID - Carcassonne
3 LGC - Laboratoire de Génétique Cellulaire
4 TSE-R - Toulouse School of Economics
5 LBME - Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote
6 France Hybride

Cet article présente l'analyse d'un réseau de co-expression entre gènes dont la particularité est d'être régulés génétiquement. Cette étude est menée selon deux axes : une classification des gènes impliqués dans le réseau permet de mettre en valeur des groupes fonctionnels homogènes. Par ailleurs, une analyse conjointe du réseau et d'un phénotype d'intérêt permet de mettre en évidence des gènes candidats importants.

Domaines: Statistiques [math.ST]; Théorie [stat.TH]

Nathalie Villa-Vialaneix, Laurence Liaubet, Thibault Laurent, Adrien Gamot, Pierre Cherel, et al.. L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêt. Journées de la Société Française de Statistique, May 2011, Tunis, Tunisie. pp.172. ⟨hal-00666613⟩