HAL : hal-00177593, version 3

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Math. Comput. Model. 49, 11-12 (2009) 2161--2169

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v3 (28-03-2008)

Applications of level set methods in computational biophysics

Emmanuel Maitre 1, Thomas Milcent 1, Georges-Henri Cottet 1, Annie Raoult 2, Yves Usson 3

(01/06/2009)

We describe in this paper two applications of Eulerian level set methods to fluid-structure problems arising in biophysics. The first one is concerned with three-dimensional equilibrium shapes of phospholipidic vesicles. This is a complex problem which can be recast as the minimization of the curvature energy of an immersed elastic membrane, under a constant area constraint. The second deals with isolated cardiomyocyte contraction. This problem corresponds to a generic incompressible fluid-structure coupling between an elastic body and a fluid. By the choice of these two quite different situations, we aim to bring evidences that Eulerian methods provide efficient and flexible computational tools in biophysics applications.

1 :	Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK)
	CNRS : UMR5224 – Université Joseph Fourier - Grenoble I – Université Pierre Mendès-France - Grenoble II – Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology
2 :	Mathématiques appliquées Paris 5 (MAP5)
	CNRS : UMR8145 – Université Paris V - Paris Descartes
3 :	Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité (TIMC)
	CNRS : UMR5525 – Université Joseph Fourier - Grenoble I

Domaine

:

Mathématiques/Analyse numérique

Mots Clés : level set methods – fluid structure interaction – biological vesicles – cell dynamics

hal-00177593, version 3

http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00177593

oai:hal.archives-ouvertes.fr:hal-00177593

Contributeur : Georges-Henri Cottet <>

Soumis le : Vendredi 28 Mars 2008, 08:16:58

Dernière modification le : Lundi 24 Août 2009, 13:23:34