Modélisation de la stéréochimie : une application à la chémoinformatique

Pierre-Anthony Grenier 1
1 Equipe Image - Laboratoire GREYC - UMR6072
GREYC - Groupe de Recherche en Informatique, Image, Automatique et Instrumentation de Caen
Résumé : Dans le domaine de la prédiction de propriétés moléculaires, les noyaux sur graphes permettent de combiner la représentation naturelle des molécules par des graphes avec des méthodes classiques d’apprentissage automatique. Malheureusement, le positionnement relatif des atomes dans l’espace peut être différent pour des molécules représentées par un même graphe. Ces molécules, appelées stéréoisomères, peuvent avoir des propriétés différentes. L’objectif de cette thèse est la prise en compte des stéréoisomères dans les méthodes à noyaux pour la prédiction de propriétés moléculaires. Nous commençons par présenter les méthodes de prédiction de propriétés moléculaires, en particulier les méthodes à noyaux. Puis, après une présentation de la stéréochimie, nous présentons un état de l’art des méthodes la prenant en compte. En se basant sur cet état de l’art, nous proposons d’utiliser des graphes ordonnés afin de représenter les stéréoisomères. Nous définissons ensuite les stéréo sous-graphes minimaux qui sont des sous-graphes caractérisant localement la stéréochimie. Ces sous-graphes servent alors à définir un noyau permettant de prendre en compte la stéréochimie. Finalement nous présentons trois extensions à ce noyau. Ces extensions permettent de considérer les voisinages des stéréo sous-graphes minimaux et de comparer des stéréo sous-graphes minimaux différents.
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Thèse
Vision par ordinateur et reconnaissance de formes [cs.CV]. Université de Caen Normandie, 2015. Français
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Soumis le : jeudi 7 janvier 2016 - 13:59:10
Dernière modification le : mardi 5 février 2019 - 12:12:45
Document(s) archivé(s) le : vendredi 8 avril 2016 - 13:24:00

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Citation

Pierre-Anthony Grenier. Modélisation de la stéréochimie : une application à la chémoinformatique. Vision par ordinateur et reconnaissance de formes [cs.CV]. Université de Caen Normandie, 2015. Français. 〈tel-01252296〉

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