Diversité génétique et délimitation d'espèces par des approches conjointes de barcoding et de génétique des populations : application à l'identification d'espèces d'algues marines nouvellement cultivées

Résumé : L’identification de certaines espèces d’algues d’après leurs caractéristiques morphologiques reste encore aujourd’hui problématique en raison notamment d’une forte plasticité phénotypique ou de phénomènes de convergence. Je me suis intéressé à l’utilisation de différents marqueurs moléculaires dans un but taxonomique. L’objectif était plus précisément de caractériser et d’étudier la diversité génétique de plusieurs espèces d’algues marines cultivables d’intérêts économiques. Dans une première partie, j’ai utilisé une approche de type barcoding multilocus afin de trouver les caractères génétiques spécifiques indispensables pour assurer la traçabilité des produits dans l’industrie des algues par une approche RFLP. La seconde partie a été consacrée à étudier la délimitation d’espèces au sein d’un genre d’algues brunes Pylaiella. Notre étude montre la présence de deux espèces cryptiques présentant un décalage saisonnier. L’utilisation de marqueurs de type microsatellite révèlent des flux de gènes limités entre ces deux entités. Dans une troisième partie l’étude basée sur l’analyse des séquences cox1 et rbcL dans le genre Polysiphonia a permis de mettre en évidence la présence de l’algue introduite Polysiphonia morrowii Harvey. Enfin, la comparaison de la diversité haplotypique entre aire native supposée et aires d’introduction révèle une diversité génétique relativement élevée dans les zones d’introduction suggérant de multiples événements d’introduction. Ces différents résultats soulignent l’importance d’approches moléculaires et intégratives pour l’identification et la délimitation d’espèces, notamment dans un contexte de traçabilité dans le milieu industriel des algues.
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Thèse
Génétique. Paris 6, 2012. Français
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Alexandre Geoffroy. Diversité génétique et délimitation d'espèces par des approches conjointes de barcoding et de génétique des populations : application à l'identification d'espèces d'algues marines nouvellement cultivées. Génétique. Paris 6, 2012. Français. 〈tel-01115945〉

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