Functional genomics of coccolithophore viruses

Résumé : L’Emiliania huxleyi virus (EhV) est un NCLDV. Il appartient à la famille des virus algaux, les Phycodnaviridae. Il infect Emiliania huxleyi, le coccolithophore le plus abondant dans les océans modernes. Nous avons montré sur une base phylogénétique le transfert de 29 gènes entre le génome d’Emiliania huxleyi et de EhV, notamment 7 gènes impliqués dans la biosynthèse des sphingolipides (SBP). C’est le premier cas patent, dans un système de virus et phytoplancton eucaryotes, de transfert horizontal de multiples gènes d’enzymes liées fonctionnellement. Pour deux des plus importantes enzymes de la SBP, la sérine palmitoyl transférase et la dihydroceramide désaturase, l’étude transcriptomique a permis de définir trois étapes au cours de la formation et de la disparition des blooms de E. huxleyi, pendant lesquelles on registre une activation progressive des transcrits de coccolithovirus, culminant avec leur contrôle de la SBP au cours des étapes 2 et 3. En utilisant la technique de puce à ADN on a réalisé la première étude transcriptomique globale entre l’hôte le virus au sein d’une communauté océanique naturel. Nos résultats montrent que durant les efflorescences de E. huxleyi il y a un épisode synchrone de dominance virale qui est clairement visible à travers les signaux transcriptomiques qui en résultent. Parmi les gènes dont la quantité de transcrits augmentent significativement entre la pre et la post dominance virale on a trouvé des fonctions impliquées dans le transfert de l’information génétique, mais aussi des gènes probablement impliqués dans le contrôle post-transitionnel, dans les mécanismes de déplacement intracellulaires, ou même dans le contrôle de l’apoptose.
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Thèse
Virology. Paris 6, 2010. English
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Contributeur : Novelenn Louise <>
Soumis le : mercredi 28 janvier 2015 - 14:14:19
Dernière modification le : jeudi 21 mars 2019 - 13:10:16
Document(s) archivé(s) le : samedi 15 avril 2017 - 23:40:01

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Antonio Joaquin Pereira Pagarete. Functional genomics of coccolithophore viruses. Virology. Paris 6, 2010. English. 〈tel-01110548〉

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