Elements of Echinococcus multilocularis transmission ecology in China (Sichuan). Modeling of host community and population spatial distributions: from field data to predictions.
Éléments d'écologie de la transmission d'Echinococcus multilocularis en Chine (Sichuan) Modélisation des distributions spatiales des communautés et populations des hôtes : des données de terrain aux prédictions
Résumé
The transmission of the parasite Echinococcus multilocularis causing a fatal zoonosis in humans, the alveolar echinococcosis, can be modulated by anthropogenic disturbances of its intermediate (small mammals) and definitive (canids) host ecology. We studied some ecological parameters of those host populations in the Sichuan Province, China, where high human prevalences are observed. On the basis of trapping data sets, the definition of small mammal assemblages has provided a way to resume the large diversity observed in sampled habitats and trapped species. We found that multiple non-linear regressions was the most performant method to model assemblage distributions along environmental gradients extracted from satellite images, such as slope, elevation and vegetation indices. While local models were not transferable on study sites distant from one hundred km, a regional classification of transmission groups could have been realized on the whole regional data set. Then, analysis of spatial distributions of canid faeces, their contaminations as well as nocturnal trajectories of dogs equipped with GPS collars, were done to assess and quantify the predominant contribution of dog over fox in the environmental contamination and to localise areas of high transmission risk, closed to human habitations. Finally, spatial interactions between dogs and small mammals were found inside villages and can be considered as a preliminary estimation of host contact rate required in transmission models.
La transmission du parasite Echinococcus multilocularis à l'origine d'une zoonose fatale chez l'homme, l'échinococcose alvéolaire, peut être modulée par des perturbations anthropiques de l'écologie des populations de ses hôtes intermédiaires (micro-mammifères) et définitifs (canidés). Nous avons étudié des paramètres écologiques des populations de ces hôtes dans la province du Sichuan, en Chine, où sont observées de fortes prévalences humaines. Sur la base de données de piégeage, la définition d'assemblages d'espèces de micro-mammifères a permis de résumer la grande diversité des habitats échantillonnés et des espèces piégées. Nous avons trouvé que les régressions multiples non-linéaires étaient la méthode la plus performante pour modéliser les distributions des assemblages le long de gradients environnementaux extraits d'images satellites telles que l'altitude, la pente et des indices de végétation. Alors que les modèles locaux n'étaient pas transférables sur des sites distants d'une centaine de km, une classification régionale des groupes de transmission a pu être établie. D'autre part, les analyses des distributions spatiales des fèces de canidés, de leurs contaminations et des trajectoires nocturnes de chiens équipés de colliers GPS ont permis de confirmer et de quantifier le rôle prédominant du chien sur le renard dans la contamination environnementale et de localiser des zones à haut risque de transmission près des habitations. Enfin, des interactions spatiales entre les chiens et les micro-mammifères ont été mises en évidence dans les villages et constituent une estimation préliminaire du taux de contact entre les hôtes requis pour modéliser la transmission.
Fichier principal
these_AVaniscotte.pdf (3.88 Mo)
Télécharger le fichier
theseAV_3011.pdf (15.91 Mo)
Télécharger le fichier
Format : Autre