Update on the diagnosis of parasitic and fungal infections
Actualités du diagnostic des infections parasitaires et fongiques
Résumé
The diagnosis of parasitic and fungal infections, historically based on the detection of these pathogens using direct diagnosis (macro/microscopic examination, culture) or serological methods, has considerably evolved in the last decades, especially with the development of molecular approaches and mass spectrometry. These techniques, as well as most analyses of parasitic and fungal serology, are mostly the preserve of Hospital University Centers Parasitology-Mycology laboratories. In 2016, the French association of medical parasitology and mycology teachers and hospital practitioners (Anofel) has provided a Catalogue of rare analyses, regularly updated and freely accessible on the Anofel website (https://anofel.net/). This tool, which hinges on 4 parts (parasitology, parasitic serology, mycology, and fungal serology), aims to provide information on all available analyses, and a list of hospital laboratories able to undertake them. It is complementary to the other reference works that were developed by our association, including the Guide of analyses and methods in parasitology and mycology, published in 2018, and the eANOFEL pictures and videos database, freely accessible online (http://www.eanofel.fr). In this article, we draw-up a state-of-the-art of the most specialized techniques available in the parasitology-mycology laboratories and presented in the Catalogue of rare analyses of the Anofel collegium, and their interest for the diagnosis of these infections.
Le diagnostic des infections parasitaires et fongiques, historiquement basé sur la détection de ces pathogènes par diagnostic direct (examen macro/microscopique, culture) ou sérologique, a connu durant les dernières décennies des évolutions importantes, avec notamment le développement d’approches moléculaires et de la spectrométrie de masse. Ces techniques, de même que la plupart des analyses en sérologie parasitaire et fongique, restent le plus souvent l’apanage des laboratoires de centres hospitaliers universitaires spécialisés en parasitologie-mycologie. En 2016, l’Association française des enseignants et praticiens hospitaliers titulaires de parasitologie et mycologie médicales (Anofel) a mis à disposition un Catalogue des analyses rares en accès libre sur le site d’Anofel (https://anofel.net/), et régulièrement mis à jour. Cet outil, qui s’articule en 4 volets (parasitologie, sérologie parasitaire, mycologie et sérologie fongique) a pour objectif de faciliter l’accès aux informations sur les analyses disponibles et les laboratoires hospitaliers capables de les prendre en charge. Il complète les autres ouvrages de référence élaborés par la collégiale Anofel, dont le Guide des analyses et méthodes en parasitologie et mycologie, publié en 2018, et la base de données d’images et de vidéos, en accès libre sur internet (http://www.eanofel.fr). L’objectif de cet article est de dresser un état des lieux des techniques plus spécialisées disponibles dans les laboratoires de parasitologie-mycologie, présentées dans le Catalogue des analyses rares de la collégiale Anofel, et leur intérêt pour le diagnostic de ces infections.
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