Le phénotypage assisté par modèle : une méthode performante pour identifier des traits de sélection pour l’architecture racinaire

Céline Richard-Molard (1) , Mathieu Gruau , Christophe Lecarpentier , Loic Pagès , Anne Laperche (2, 3)

1 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
2 AGROCAMPUS OUEST
3 IGEPP - Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes

Être capable de caractériser la diversité génétique du système racinaire est un enjeu réel pour la sélection, et notamment pour proposer des variétés multi-performantes, adaptées aux nouveaux agro-écosystèmes au sein desquels les interactions plante-sol jouent un rôle majeur, du fait des multiples fonctions du système racinaire. Cependant les méthodes directes de phénotypage au champ du système racinaire sont rarement compatibles avec la caractérisation d’un grand nombre d’accessions. De ce fait, le système racinaire est souvent caractérisé à des stades précoces et dans des conditions contrôlées, ne permettant pas toujours une bonne prédiction des phénotypes en conditions agronomiques. Ici nous présentons une méthode complémentaire, le phénotypage assisté par modèle, basée sur le phénotypage de variables “processus”, estimées à partir du modèle ARCHISIMPLE et permettant d’accéder aux mécanismes contrôlant la mise en place de l’architecture racinaire. La mise en oeuvre de cette approche novatrice pour la caractérisation des systèmes racinaires est ensuite illustrée à travers l’analyse de la diversité génétique de l’architecture racinaire du colza. Nous montrons comment ces paramètres du modèle constituent des traits de sélection efficaces, permettant de proposer des idéotypes adaptés à des systèmes de culture à faibles niveaux d’intrants azotés, qui optimisent l’exploration du sol et l’absorption de l’azote.

Mots clés: architecture racinaire; plasticité; traits de sélection; modélisation; ArchiSimple; colza; faibles intrants azotés; diversité génétique

Domaines: Sciences du Vivant [q-bio]

Céline Richard-Molard, Mathieu Gruau, Christophe Lecarpentier, Loic Pagès, Anne Laperche. Le phénotypage assisté par modèle : une méthode performante pour identifier des traits de sélection pour l’architecture racinaire. Sélectionneur Français, 2019, Le sytème radiculaire et la rhizosphère en amélioration des plantes, 70, pp.21-30. ⟨hal-03194858⟩