Restauration 3D en imagerie fluorescente par feuille de lumière avec implantation sur GPU

François de Vieilleville (1) , Pierre Weiss (2) , Valérie Lobjois (3) , Denis Kouamé (1)

1 IRIT-TCI - Traitement et Compréhension d’Images
2 IMT - Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219
3 ITAV - Institut des Technologies Avancées en sciences du Vivant

Light sheet fluorescence microscopy is a recent and promising technology which allows a selective illumination of biologic samples. For this modality we propose to use a GPU-implanted fast deconvolution algorithm, to be used with fusion methods. The proposed algorithm can deblur an image with1000×1000×100voxels in less than 5 minutes

L’imagerie microscopique à feuille de lumière est une technologie très récente et prometteuse permettant une illumination sélective des échantillons biologiques étudiés. Pour cette technique nous proposons l’implantation sur GPU d’un algorithme de déconvolution rapide, complétant des méthodes par fusion. L’algorithme proposé permet en pratique de déconvoluer des images de taille1000×1000×100en des temps inférieurs à 5 minutes.

Domaines: Traitement du signal et de l'image [eess.SP]

François de Vieilleville, Pierre Weiss, Valérie Lobjois, Denis Kouamé. Restauration 3D en imagerie fluorescente par feuille de lumière avec implantation sur GPU. Colloque du Groupe de Recherche sur le Traitement du Signal et des Images (GRETSI 2011), Association GRETSI (Groupement de Recherche en Traitement du Signal et des Images), Sep 2011, Bordeaux, France. ⟨hal-03146732⟩