Report on computational assessment of Tumor Infiltrating Lymphocytes from the International Immuno-Oncology Biomarker Working Group
Mohamed Amgad
,
Elisabeth Specht Stovgaard
,
Eva Balslev
(1)
,
Jeppe Thagaard
,
Weijie Chen
,
Sarah Dudgeon
,
Ashish Sharma
(2)
,
Jennifer Kerner
,
Carsten Denkert
(3)
,
Yinyin Yuan
,
Khalid Abduljabbar
,
Stephan Wienert
,
Peter Savas
,
Leonie Voorwerk
,
Andrew Beck
,
Anant Madabhushi
,
Johan Hartman
,
Manu Sebastian
,
Hugo Horlings
(4)
,
Jan Hudeček
,
Francesco Ciompi
,
David Moore
(5)
,
Rajendra Singh
,
Elvire Roblin
,
Marcelo Luiz Balancin
,
Marie-Christine Mathieu
(6)
,
Jochen Lennerz
,
Pawan Kirtani
,
I-Chun Chen
,
Jeremy Braybrooke
,
Giancarlo Pruneri
(7)
,
Sandra Demaria
,
Sylvia Adams
,
Stuart Schnitt
,
Sunil R Lakhani
(8)
,
Federico Rojo
(9)
,
Laura Comerma
,
Sunil Badve
,
Mehrnoush Khojasteh
,
W Fraser Symmans
,
Christos Sotiriou
(10)
,
Paula Gonzalez-Ericsson
,
Katherine Pogue-Geile
,
Rim Kim
,
David Rimm
,
Giuseppe Viale
(11)
,
Stephen Hewitt
,
John Bartlett
(12)
,
Frédérique Penault-Llorca
(13, 14)
,
Shom Goel
,
Huang-Chun Lien
,
Sibylle Loibl
(15)
,
Zuzana Kos
,
Sherene Loi
(16)
,
Matthew Hanna
,
Stefan Michiels
(17, 18, 19)
,
Marleen Kok
(20)
,
Torsten Nielsen
,
Alexander J Lazar
(21)
,
Zsuzsanna Bago-Horvath
(22)
,
Loes Kooreman
,
Jeroen van Der Laak
,
Joel Saltz
,
Brandon Gallas
,
Uday Kurkure
(23)
,
Michael Barnes
,
Roberto Salgado
(16)
,
Lee Cooper
1
Department of Pathology
2 The University of Sydney
3 Charité, Institute of Pathology, Translational Tumorpathology Unit
4 Division of Experimental Therapy
5 Innovation North - Faculty of Information and Technology
6 Pathologie morphologique
7 ESMO - European Institute of Oncology [Milan]
8 USQ - University of Southern Queensland
9 IFT - Instituto de Física Teórica UAM/CSIC
10 Institut Jules Bordet [Bruxelles]
11 Division of Pathology and Laboratory Medicine
12 USC - University of the Sunshine Coast
13 UNICANCER/CJP - Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand]
14 IMoST - Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques
15 GBG - German Breast Group
16 Breast Cancer Translational Research Laboratory
17 SBE - Service de biostatistique et d'épidémiologie
18 IGR - Institut Gustave Roussy
19 U1018 (Équipe 2) - Oncostat
20 Department of Pathology
21 The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston]
22 Medizinische Universität Wien = Medical University of Vienna
23 CBL - Computational Biomedicine Lab
2 The University of Sydney
3 Charité, Institute of Pathology, Translational Tumorpathology Unit
4 Division of Experimental Therapy
5 Innovation North - Faculty of Information and Technology
6 Pathologie morphologique
7 ESMO - European Institute of Oncology [Milan]
8 USQ - University of Southern Queensland
9 IFT - Instituto de Física Teórica UAM/CSIC
10 Institut Jules Bordet [Bruxelles]
11 Division of Pathology and Laboratory Medicine
12 USC - University of the Sunshine Coast
13 UNICANCER/CJP - Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand]
14 IMoST - Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques
15 GBG - German Breast Group
16 Breast Cancer Translational Research Laboratory
17 SBE - Service de biostatistique et d'épidémiologie
18 IGR - Institut Gustave Roussy
19 U1018 (Équipe 2) - Oncostat
20 Department of Pathology
21 The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston]
22 Medizinische Universität Wien = Medical University of Vienna
23 CBL - Computational Biomedicine Lab
Mohamed Amgad
- Fonction : Auteur
Elisabeth Specht Stovgaard
- Fonction : Auteur
Jeppe Thagaard
- Fonction : Auteur
Weijie Chen
- Fonction : Auteur
Sarah Dudgeon
- Fonction : Auteur
Jennifer Kerner
- Fonction : Auteur
Carsten Denkert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763124
- ORCID : 0000-0002-2249-0982
Yinyin Yuan
- Fonction : Auteur
Khalid Abduljabbar
- Fonction : Auteur
Stephan Wienert
- Fonction : Auteur
Peter Savas
- Fonction : Auteur
Leonie Voorwerk
- Fonction : Auteur
Andrew Beck
- Fonction : Auteur
Anant Madabhushi
- Fonction : Auteur
Johan Hartman
- Fonction : Auteur
Manu Sebastian
- Fonction : Auteur
Hugo Horlings
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762548
- ORCID : 0000-0003-4782-8828
Jan Hudeček
- Fonction : Auteur
Francesco Ciompi
- Fonction : Auteur
Rajendra Singh
- Fonction : Auteur
Elvire Roblin
- Fonction : Auteur
Marcelo Luiz Balancin
- Fonction : Auteur
Jochen Lennerz
- Fonction : Auteur
Pawan Kirtani
- Fonction : Auteur
- PersonId : 801678
- ORCID : 0000-0002-2343-7016
I-Chun Chen
- Fonction : Auteur
Jeremy Braybrooke
- Fonction : Auteur
Sandra Demaria
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785538
- ORCID : 0000-0003-4426-0499
Sylvia Adams
- Fonction : Auteur
Stuart Schnitt
- Fonction : Auteur
Laura Comerma
- Fonction : Auteur
Sunil Badve
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785539
- ORCID : 0000-0001-8861-9980
Mehrnoush Khojasteh
- Fonction : Auteur
W Fraser Symmans
- Fonction : Auteur
Christos Sotiriou
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762547
- ORCID : 0000-0002-5745-9977
Paula Gonzalez-Ericsson
- Fonction : Auteur
Katherine Pogue-Geile
- Fonction : Auteur
Rim Kim
- Fonction : Auteur
David Rimm
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785541
- ORCID : 0000-0001-5820-4397
Stephen Hewitt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785540
- ORCID : 0000-0001-8283-1788
John Bartlett
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785533
- ORCID : 0000-0002-0347-3888
Frédérique Penault-Llorca
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1188534
- ORCID : 0000-0002-4279-5492
- IdRef : 076501450
Shom Goel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 801680
- ORCID : 0000-0001-8329-9084
Huang-Chun Lien
- Fonction : Auteur
Zuzana Kos
- Fonction : Auteur
Sherene Loi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 764698
- ORCID : 0000-0001-6137-9171
Matthew Hanna
- Fonction : Auteur
Stefan Michiels
- Fonction : Auteur
- PersonId : 759812
- IdHAL : stefan-michiels
- ORCID : 0000-0002-6963-2968
- IdRef : 129474622
Torsten Nielsen
- Fonction : Auteur
Loes Kooreman
- Fonction : Auteur
Jeroen van Der Laak
- Fonction : Auteur
Joel Saltz
- Fonction : Auteur
Brandon Gallas
- Fonction : Auteur
Michael Barnes
- Fonction : Auteur
Roberto Salgado
- Fonction : Auteur
- PersonId : 779439
- ORCID : 0000-0002-1110-3801
Lee Cooper
- Fonction : Auteur
Résumé
Assessment of tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) is increasingly recognized as an integral part of the prognostic workflow in triple-negative (TNBC) and HER2-positive breast cancer, as well as many other solid tumors. This recognition has come about thanks to standardized visual reporting guidelines, which helped to reduce inter-reader variability. Now, there are ripe opportunities to employ computational methods that extract spatio-morphologic predictive features, enabling computer-aided diagnostics. We detail the benefits of computational TILs assessment, the readiness of TILs scoring for computational assessment, and outline considerations for overcoming key barriers to clinical translation in this arena. Specifically, we discuss: 1. ensuring computational workflows closely capture visual guidelines and standards; 2. challenges and thoughts standards for assessment of algorithms including training, preanalytical, analytical, and clinical validation; 3. perspectives on how to realize the potential of machine learning models and to overcome the perceptual and practical limits of visual scoring.
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte