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Homology-Free Detection of Transposable Elements Unveils Their Dynamics in Three Ecologically Distinct Rhodnius Species
Marcelo Castro Clément Goubert 1 Fernando Monteiro 2 Cristina Vieira 1, 3, 4, 5 Claudia M A Carareto 6
1
Eléments transposables, évolution, populations
GINSENG - Département génétique, interactions et évolution des génomes [LBBE]
5
ERABLE - Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale
Inria Grenoble - Rhône-Alpes
Marcelo Castro
Author
Clément Goubert 1
Author
ORCID : 0000-0001-8034-5559
Fernando Monteiro 2
Author
Cristina Vieira 1, 3, 4, 5
Author
IdHAL : cristina-vieiraORCID : 0000-0003-3414-3993IdRef : 121157318
Claudia M A Carareto 6
Author
1
Eléments transposables, évolution, populations (LBBE
43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- GINSENG - Département génétique, interactions et évolution des génomes [LBBE] (LBBE
43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
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PROCAM - Programa de Pós graduação em Ciência Ambiental (Brazil)
- USP - Universidade de São Paulo (Cidade Universitaria - 05508-090 São Paulo - Brazil)
3
GINSENG - Département génétique, interactions et évolution des génomes [LBBE] (LBBE
43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
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LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (43 Bld du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5558 (France)
5
ERABLE - Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale (Université Claude Bernard (Lyon 1),
Campus DOUA
43, Boulevard du 11 Novembre 1918
69622 Villeurbanne cedex - France)
- Inria Grenoble - Rhône-Alpes (Inovallée
655 avenue de l'Europe
38330 Montbonnot - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
6
UNESP - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho = São Paulo State University (Rua Quirino de Andrade, 215 - Centro - São Paulo/SP - CEP 01049-010 - Brazil)
Document type :
Journal articles
Complete list of metadata
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02487180
Contributor : Cristina Vieira Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, February 21, 2020 - 2:10:53 PM
Last modification on : Saturday, July 9, 2022 - 4:02:04 AM
Contributor : Cristina Vieira Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, February 21, 2020 - 2:10:53 PM
Last modification on : Saturday, July 9, 2022 - 4:02:04 AM
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Identifiers
- HAL Id : hal-02487180, version 1
- DOI : 10.3390/genes11020170
- PUBMEDCENTRAL : PMC7073582
Citation
Marcelo Castro, Clément Goubert, Fernando Monteiro, Cristina Vieira, Claudia M A Carareto. Homology-Free Detection of Transposable Elements Unveils Their Dynamics in Three Ecologically Distinct Rhodnius Species. Genes, MDPI, 2020, 11 (2), pp.170. ⟨10.3390/genes11020170⟩. ⟨hal-02487180⟩
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