V. E. Haber and R. Spaventi, Prog Mol Subcell Biol, vol.55, pp.91-104, 2017.

J. P. Hughes, S. Rees, S. B. Kalindjian, and K. L. Philpott, Br J Pharmacol, vol.162, pp.1239-1249, 2011.

B. Munos, Nature Reviews Drug Discovery, pp.959-968, 2009.

J. P. Renaud and M. A. Delsuc, Current Opinion in Pharmacology, vol.9, pp.622-628, 2009.

R. Macarron, M. N. Banks, D. Bojanic, D. J. Burns, D. A. Cirovic et al., Nat Rev Drug Discov, vol.10, pp.188-195, 2011.

R. Lahana, Drug Discovery Today, pp.447-448, 1999.

C. W. Murray and D. C. Rees, Nature Chemistry, vol.1, pp.187-192, 2009.

P. J. Hajduk and J. Greer, Nature Reviews Drug Discovery, vol.6, pp.211-219, 2007.

D. A. Erlanson, S. W. Fesik, R. E. Hubbard, W. Jahnke, and H. Jhoti, Nat Rev Drug Discov, vol.15, pp.605-619, 2016.

M. J. Harner, A. O. Frank, and S. W. Fesik, J Biomol NMR, vol.56, pp.65-75, 2013.

A. J. Souers, J. D. Leverson, E. R. Boghaert, and S. L. ,

N. D. Ackler, J. Catron, B. D. Chen, H. Dayton, S. H. Ding et al.,

S. G. Huang, S. Hymowitz, S. L. Jin, P. J. Khaw, L. T. Kovar et al., Nat Med, vol.19, pp.202-208, 1036.

R. Deprez-poulain and B. Deprez, Curr Top Med Chem, vol.4, pp.569-580, 2004.

R. Poulain, D. Horvath, B. Bonnet, C. Eckoff, B. Chapelain et al., J. Med. Chem, vol.44, pp.3391-3401, 2001.

A. Alanine, M. Nettekoven, E. Roberts, and A. W. Thomas, Comb Chem High Throughput Screen, vol.6, pp.51-66, 2003.

K. H. Bleicher, H. J. Böhm, K. Müller, and A. I. Alanine, Nat Rev Drug Discov, vol.2, pp.369-378, 2003.

G. Sliwoski, S. Kothiwale, J. Meiler, and E. W. Lowe, Pharmacol Rev, vol.66, pp.334-395, 2014.

W. L. Jorgensen, Acc Chem Res, vol.42, pp.724-733, 2009.

W. Yu and A. D. Mackerell, Methods Mol Biol, vol.1520, pp.85-106, 2017.

T. Wang, M. B. Wu, J. P. Lin, and L. R. Yang, Expert Opin Drug Discov, vol.10, pp.1283-1300, 2015.

T. Wang, M. B. Wu, R. H. Zhang, Z. J. Chen, C. Hua et al., Curr Top Med Chem, vol.16, pp.901-916, 2016.

P. ?led? and A. Caflisch, Curr Opin Struct Biol, vol.48, pp.93-102, 2018.

B. O. Villoutreix, R. Eudes, and M. A. Miteva, Comb Chem High Throughput Screen, vol.12, pp.1000-1016, 2009.

S. Kalyaanamoorthy and Y. P. Chen, Drug Discov Today, vol.16, pp.831-839, 2011.

R. L. Van-montfort and P. Workman, Essays Biochem, vol.61, pp.431-437, 2017.

R. J. Bienstock, Methods Mol Biol, vol.1289, pp.119-135, 2015.

L. Hoffer, J. P. Renaud, and D. Horvath, Comb Chem High Throughput Screen, vol.14, pp.500-520, 2011.

V. Borsi, V. Calderone, M. Fragai, C. Luchinat, and N. Sarti, Journal of Medicinal Chemistry, vol.53, pp.4285-4289, 2010.

J. J. Barker, O. Barker, S. M. Courtney, M. Gardiner, T. Hesterkamp et al., ChemMedChem, vol.5, pp.1697-1700, 2010.

R. Law, O. Barker, J. J. Barker, T. Hesterkamp, R. Godemann et al., Journal of Computer-Aided Molecular Design, vol.23, pp.459-473, 2009.

K. Loving, I. Alberts, and W. Sherman, Current Topics in Medicinal Chemistry, vol.10, pp.14-32, 2010.

T. Langer and R. D. Hoffmann, Expert Opin Drug Discov, vol.1, pp.261-267, 2006.

G. Marcou and D. Rognan, J Chem Inf Model, vol.47, pp.195-207, 2007.

G. Schneider and U. Fechner, Nature Reviews Drug Discovery, vol.4, pp.649-663, 2005.

M. Hartenfeller and G. Schneider, Methods Mol Biol, vol.672, pp.299-323, 2011.

X. Q. Lewell, D. B. Judd, S. P. Watson, and M. M. Hann, Journal of Chemical Information and Computer Sciences, vol.38, pp.511-522, 1998.

J. Degen, C. Wegscheid-gerlach, A. Zaliani, and M. Rarey, Chemmedchem, vol.3, pp.1503-1507, 2008.

P. Schneider and G. Schneider, J Med Chem, vol.59, pp.4077-4086, 2016.

B. B. Masek, D. S. Baker, R. J. Dorfman, K. Dubrucq, V. C. Francis et al., J Chem Inf Model, vol.56, pp.605-620, 2016.

S. Takeda, H. Kaneko, and K. Funatsu, J Chem Inf Model, vol.56, pp.1885-1893, 2016.

M. Hartenfeller, M. Eberle, P. Meier, C. Nieto-oberhuber, K. Altmann et al., Journal of Chemical Information and Modeling, vol.51, pp.3093-3098, 2011.

M. Hartenfeller, H. Zettl, M. Walter, M. Rupp, F. Reisen et al., PLoS Comput Biol, vol.8, p.1002380, 2012.

W. J. Allen, B. C. Fochtman, T. E. Balius, and R. C. Rizzo, J Comput Chem, vol.38, pp.2641-2663, 2017.

G. F. Hao, W. Jiang, Y. N. Ye, F. X. Wu, X. L. Zhu et al., Nucleic Acids Res, vol.44, pp.550-556, 2016.

P. Maass, T. Schulz-gasch, M. Stahl, and M. Rarey, Journal of Chemical Information and Modeling, vol.47, pp.390-399, 2007.

J. Degen and M. Rarey, ChemMedChem, vol.1, pp.854-868, 2006.

Y. Li, Z. Zhao, Z. Liu, M. Su, and R. Wang, J Chem Inf Model, vol.56, pp.435-453, 2016.

L. Hoffer, J. P. Renaud, and D. Horvath, J Chem Inf Model, vol.53, pp.836-851, 2013.

L. Hoffer, Y. V. Voitovich, B. Raux, K. Carrasco, C. Muller et al., , 2018.

H. Böhm, J Comput Aided Mol Des, vol.6, pp.61-78, 1992.

A. Caflisch, A. Miranker, and M. Karplus, J Med Chem, vol.36, pp.2142-2167, 1993.

S. Rotstein and M. Murcko, Journal of Medicinal Chemistry, vol.36, pp.1700-1710, 1993.

D. Westhead, D. Clark, D. Frenkel, J. Li, C. Murray et al., J Comput Aided Mol Des, vol.9, pp.139-148, 1995.

R. Dewitte and E. Shakhnovich, Journal of the American Chemical Society, pp.11733-11744, 1996.

G. Lauri and P. A. Bartlett, J Comput Aided Mol Des, vol.8, pp.51-66, 1994.

V. Gillet, A. P. Johnson, P. Mata, S. Sike, and P. Williams, J. Comput. Aided Mol. Des, vol.7, pp.127-153, 1993.

H. Vinkers, M. De-jonge, F. Daeyaert, J. Heeres, L. Koymans et al., J Med Chem, vol.46, pp.2765-2773, 2003.

M. Davies, T. Heikkilä, G. A. Mcconkey, C. W. Fishwick, M. R. Parsons et al., J Med Chem, vol.52, pp.2683-2693, 2009.

N. Y. Mok, J. Chadwick, K. A. Kellett, E. Casas-arce, N. M. Hooper et al., J Med Chem, vol.56, pp.1843-1852, 2013.

R. Wang, Y. Gao, and L. Lai, Molecular modeling annual, vol.6, pp.498-516, 2000.

Y. Yuan, J. Pei, and L. Lai, J Chem Inf Model, vol.51, pp.1083-1091, 2011.

S. Ni, Y. Yuan, J. Huang, X. Mao, M. Lv et al., J Med Chem, vol.52, pp.5295-5298, 2009.

J. D. Durrant, R. E. Amaro, and J. A. Mccammon, Chemical Biology & Drug Design, vol.73, pp.168-178, 2009.

J. D. Durrant, S. Lindert, and J. A. Mccammon, J Mol Graph Model, vol.44, pp.104-112, 2013.

O. Trott and A. J. Olson, J Comput Chem, vol.31, pp.455-461, 2010.

A. R. Beccari, C. Cavazzoni, C. Beato, and G. Costantino, J Chem Inf Model, vol.53, pp.1518-1527, 2013.

N. Chéron, N. Jasty, and E. I. Shakhnovich, J Med Chem, vol.59, pp.4171-4188, 2016.

F. Chevillard, H. Rimmer, C. Betti, E. Pardon, S. Ballet et al., J Med Chem, vol.61, pp.1118-1129, 2018.

N. Majeux, M. Scarsi, J. Apostolakis, C. Ehrhardt, and A. Caflisch, Proteins, vol.37, pp.88-105, 1999.

T. J. Ewing, S. Makino, G. A. Skillman, and I. D. Kuntz, Journal of Computer-Aided Molecular Design, vol.15, pp.411-428, 2001.

B. A. Ellingson, M. T. Geballe, S. Wlodek, C. I. Bayly, A. G. Skillman et al., J Comput Aided Mol Des, vol.28, pp.289-298, 2014.

F. Y. Lin, E. X. Esposito, and Y. J. Tseng, Front Pharmacol, vol.9, p.96, 2018.

R. Schulz, A. Atef, D. Becker, F. Gottschalk, C. Tauber et al., J Med Chem, vol.61, pp.1218-1230, 2018.

G. Wolber and T. Langer, J. Chem. Inf. Mod, vol.45, pp.160-169, 2005.

A. Evers, G. Hessler, L. H. Wang, S. Werrel, P. Monecke et al., J Med Chem, vol.56, pp.4656-4670, 2013.

L. Wang, A. Evers, P. Monecke, and T. Naumann, Journal of Cheminformatics, vol.2012, p.20

L. Batiste, A. Unzue, A. Dolbois, F. Hassler, X. Wang et al., ACS Cent Sci, vol.4, pp.180-188, 2018.

S. Ruiz-carmona, D. Alvarez-garcia, N. Foloppe, A. B. Garmendia-doval, S. Juhos et al., PLoS Comput Biol, vol.10, p.1003571, 2014.

B. R. Brooks, R. E. Bruccoleri, B. D. Olafson, D. J. States, S. Swaminathan et al., Journal of Computational Chemistry, vol.4, pp.187-217, 1983.

L. Hoffer and D. Horvath, J Chem Inf Model, vol.53, pp.88-102, 2013.

L. Hoffer, C. Chira, G. Marcou, A. Varnek, and D. Horvath, Molecules, vol.20, pp.8997-9028, 2015.

B. Raux, Y. Voitovich, C. Derviaux, A. Lugari, E. Rebuffet et al., J Med Chem, vol.59, pp.1634-1641, 2016.

G. L. Card, L. Blasdel, B. P. England, C. Zhang, Y. Suzuki et al., Nat Biotechnol, vol.23, pp.201-207, 2005.

Y. Matsui, I. Yasumatsu, T. Asahi, T. Kitamura, K. Kanai et al., Bioorg Med Chem, vol.25, pp.3540-3546, 2017.

P. O. Nikiforov, S. Surade, M. Blaszczyk, V. Delorme, P. Brodin et al., Org Biomol Chem, vol.14, pp.2318-2326, 2016.