Séparation d'haplotypes à partir de données de séquençage de troisième génération
Résumé
Les algorithmes d'assemblage actuels n'ont pas de performances satisfaisantes lorsque confrontés à des reads obtenus par des technologies de troisième génération issus de génomes diploïdes très hétérozygotes. On propose alors une méthode pour classer ces reads selon leur haplotype d'origine avant l'étape d'assemblage à partir d'un partitionnement sur les k-mers de ces reads.
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)