Conception d'une ontologie générique pour la représentation sémantique des biomarqueurs d'imagerie

Emna Amdouni (1, 2) , Bernard Gibaud (1)

1 LTSI - Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image
2 IRT b-com - Institut de Recherche Technologique b-com

In this paper, we propose a modelling of the concept of imaging biomarker in order to remove confusion related to this concept and facilitate its comprehension, sharing and reuse. We have identified main semantic axis that define this concept: measured quality, measurement tool and decision tool. We have proposed a generic ontology that articulates these three aspects. In this paper, we show how we have built our ontology by reusing existing ontologies.

Dans ce travail, nous proposons une modélisation du concept de biomarqueur d'imagerie pour lever l'ambiguïté qui est liée à ce concept et pour faciliter sa compréhension, son partage et sa réutilisation. Nous avons identifié, à travers plusieurs sources d'information, les principaux axes sémantiques qui contribuent à définir ce concept de biomarqueur d'imagerie et qui sont : la qualité biologique mesurée, l'outil de mesure et l'outil d'aide à la prise de décision. Nous avons proposé une ontologie générique qui articule les trois principaux aspects que nous avons identifiés pour représenter ce concept. Cet article montre comment nous avons construit cette ontologie à partir d'ontologies existantes.

Mots clés: imaging biomarker; personalized medicine; biomedical ontologies

Domaines: Imagerie médicale

Emna Amdouni, Bernard Gibaud. Conception d'une ontologie générique pour la représentation sémantique des biomarqueurs d'imagerie. Journées Françaises sur les Ontologies, Oct 2016, Bordeaux, France. ⟨hal-01859247⟩