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Communication Dans Un Congrès Année : 2017

Les petits ARN non codants du spermatozoïde bovin, de potentiels biomarqueurs de la fertilité mâle ?

Résumé

Le spermatozoïde a longtemps été considéré comme un taxi, protégeant et transportant son patrimoine génétique jusqu’à la délivrance dans l’ovocyte. Mais depuis quelques années de nouveaux arguments, autour des mécanismes épigénétiques, tels que les petits ARN non codants (sncRNA), proposent une nouvelle vision de la fonction du spermatozoïde par son implication dans le développement précoce de l’embryon (Gapp et al., 2014 ; Kotaja 2014 ; Boissonnas et al., 2013 ; Stopka et al., 2003 ; Liu et al., 2012). Or, chez les animaux de rente et en particulier chez les bovins, le contrôle de la fertilité est un élément central pour une diffusion optimale du progrès génétique. L’analyse des paramètres fonctionnels, traduisant la qualité du spermatozoïde, a longtemps été considérée comme une source importante de biomarqueurs du pouvoir fécondant de la semence. Mais malgré des résultats intéressants, la prédiction de la fertilité reste aujourd’hui inefficace (Sellem et al., 2015). C’est pourquoi la recherche de nouveaux biomarqueurs, tels que les sncRNA du spermatozoïde, a été entrepris. Notre étude a été conduite afin d’une part d’établir un catalogue exhaustif du contenu en sncRNA du spermatozoïde bovin et d’autre part de mettre en évidence de potentiels miRNA liés à la fertilité des taureaux. De l'ARN total a été extrait de 40 éjaculats provenant de taureaux Holstein et Montbeliard avec des fertilités contrastées, en utilisant un nouveau protocole amélioré. Deux contrôles qualité ont été effectués sur l'ARN extrait, afin de mesurer les quantités d'ARN (technologie Qubit) et de vérifier si un miARN de référence (miR125) a pu être détecté par RTqPCR. Les 40 banques NGS ont été préparées avec une sélection de taille (<200 nucléotides) et séquencées à une profondeur de 40 millions de reads (50 pb, Illumina HiSeq; Exiqon). Deux tiers des reads ont été annotés comme des miARN (16%), ARNr (13%), ARNt (7,5%), ARN long non codant (7,2%), ARN mitochondrial (6,5%) et ARNm (17%). Les séquences inconnues restantes sont cohérentes en termes de taille avec les piRNA, la catégorie la plus représentée dans le spermatozoïde. Mais aucune banque spécifique au bovin n’est disponible. Et il semblerait que les séquences ne soient pas conservées entre espèces. C’est pourquoi les piRNA du spermatozoïde bovin n’ont pas été détectés. Selon l'utilisation de l’algorithme miRDeep2, 3196 miARN exprimés dans tous les échantillons ont été identifiés, dont 583 connus et 2613 putatifs. L'analyse statistique effectuée à l'aide du paquet DESeq2 a mis l'accent sur 47 miARN differentiellement exprimés entre les groupes de fertilité. Cette étude souligne le potentiel des sncRNA des spermatozoïdes en tant que biomarqueurs de la fertilité du taureau.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01608764 , version 1 (03-10-2017)

Licence

Paternité - Partage selon les Conditions Initiales

Identifiants

  • HAL Id : hal-01608764 , version 1
  • PRODINRA : 396226

Citer

Eli Sellem, Sylvain Marthey, Hélène Kiefer, Chrystelle Le Danvic, Aurélie Allais-Bonnet, et al.. Les petits ARN non codants du spermatozoïde bovin, de potentiels biomarqueurs de la fertilité mâle ?. 3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1p. ⟨hal-01608764⟩
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