Biochem-Env, une plateforme au service de la caractérisation biochimique des sols

Olivier Crouzet (1) , Nathalie Cheviron (1) , Virginie Grondin (1) , Sylvie Nelieu (1) , Christian Mougin (1)

1 PESSAC - Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés

L’infrastructure de recherche « Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes » ANAEE-S (http://www.anaee-s.fr), coordonnée par le CNRS, l’INRA et l’Université Joseph Fourier, constitue la contribution française au projet européen ANAEE, inscrit sur la feuille de route de l’ESFRI, qui intègre les grandes infrastructures de recherche européennes. Le consortium ANAEE-S associe 11 partenaires institutionnels et 30 sites expérimentaux. Il ambitionne de comprendre et de prédire la dynamique de la biodiversité et des écosystèmes dans un contexte de changement global. Il permettra de progresser sur la compréhension des interactions gènes/environnement au travers de plateformes expérimentales et de modélisation dédiées à la biologie des écosystèmes continentaux, terrestres et aquatiques. Dans ce consortium, la plate-forme Biochem-Env (http://www.biochemenv.fr) a pour objectif de fournir des compétences, des installations et des services de caractérisation biochimique des milieux naturels terrestres et aquatiques, ainsi que de la macrofaune associée. Elle a été créée en 2012 avec le soutien du projet ANAEE-S et de l’INRA, au sein de l’unité PESSAC de Versailles. La plateforme Biochem-Env a deux missions principales. C’est en premier lieu une plateforme technique qui permet le développement et la veille technologique sur les outils de caractérisation biochimique (activités enzymatiques globales, biomarqueurs enzymatiques et lipidiques, acides gras phospholipidiques, activité catabolique…) de matrices environnementales solides (sols et sédiments), ainsi que sur les outils de caractérisation biochimique de la macrofaune terrestre et benthique (biomarqueurs enzymatiques, réserves énergétiques…). Elle ambitionne par exemple d’améliorer les outils biochimiques existants pour l’évaluation de la qualité biologique des milieux et de proposer à la normalisation AFNOR et ISO de nouveaux protocoles expérimentaux. Elle propose également de construire un Système d’Information Environnementale centré sur le développement d’une base de données. Cette base pourra être à terme interfacée avec d’autres bases nationales comme la base MicroSol de la plateforme Genosol (elle aussi partenaire du consortium ANAEE-S). Ce système d’information permettra de gérer la traçabilité des échantillons, de stocker et d’analyser les données de caractérisation biochimique des sols et de la macrofaune. La base de données permettra d’élaborer un véritable référentiel d’interprétation et de traduction de la diversité fonctionnelle des sols.

Domaines: Sciences du Vivant [q-bio]

Olivier Crouzet, Nathalie Cheviron, Virginie Grondin, Sylvie Nelieu, Christian Mougin. Biochem-Env, une plateforme au service de la caractérisation biochimique des sols. COMIFER - 11èmes rencontres de la fertilisation raisonnée et de l’analyse, Nov 2013, Poitiers, France. 2013. ⟨hal-01601953⟩