Can we trust untargeted metabolomics: first results of the metabo-ring study

Alexandre Verdu (1) , Bernard Lyan (2) , Carole Migné (2) , Catherine Defoort (3) , Cécile Canlet (4) , Christophe Junot (5) , Claude Guillou (6) , Claudine Manach (2) , Christophe Cordella (7) , Daniel Jacob (8) , Delphine Jouan-Rimbaud Bouveresse (7) , Douglas Rutledge (7) , Estelle Rathahao-Paris (7) , Estelle Pujos-Guillot (2) , Fabien Jourdan (9) , Franck Giacomoni (2) , Frédérique Courant (10) , Gaëlle Fave (3) , Gwanaelle Le Gall (11) , Hubert Chassaigne (6) , Jean-Charles Martin (3, 12, 13) , Jean Claude Tabet (14, 15) , Jean-Philippe Antignac (10) , Laetitia Shintu (16) , Marianne Defernez (11) , Marie-Cécile Alexandre-Gouaubau (16) , Marie Josephe Amiot-Carlin (3) , Mathilde Bossis (6) , Mathieu Maillot (3) , Mohamed N. Triba (17, 15) , Natali Stojilkovic (18) , Nathalie Banzet (19) , Roland Molinié (20) , Romain Bott (3) , Sophie Goulitquer (21, 15) , Stefano Caldarelli (16) , Thomas Moyon (22)

1 Bruker
2 UNH - Unité de Nutrition Humaine
3 NORT - Nutrition, obésité et risque thrombotique
4 E20 - MetaToul AXIOM
5 LEMM - Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments
6 Joint Research Centre - Institute for Health and Consumer Protection
7 GENIAL - Ingénierie Procédés Aliments
8 BFP - Biologie du fruit et pathologie
9 ToxAlim-MeX - Métabolisme et Xénobiotiques
10 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
11 Institute of Food Research
12 INRA - Institut National de la Recherche Agronomique
13 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
14 IPCM - Institut Parisien de Chimie Moléculaire
15 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
16 ISM2 - Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
17 CSPBAT - Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques
18 LCH - Laboratoire des Courses Hippiques
19 TIMONE - Hôpital de la Timone [CHU - APHM]
20 BIOPI - Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900
21 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
22 PhAN - Physiopathologie des Adaptations Nutritionnelles

We designed a ring test to evaluate the convergence of the same biological information extracted from various NMR (n=4) and MS (4 QTOF and 4 orbitraps) in non-targeted metabolomics. The same rat plasma samples were analyzed by all the participants. Convergence within NMR (78 to 91%) were slightly better than within MS (57 to 87%). Convergence between NMR and MS was lower (37 to 87%). Improvement can be easily achieved by a tight standardization.

Domaines: Sciences du Vivant [q-bio]

Alexandre Verdu, Bernard Lyan, Carole Migné, Catherine Defoort, Cécile Canlet, et al.. Can we trust untargeted metabolomics: first results of the metabo-ring study. 8. Annual International Meeting of the Metabolomics Society, Jun 2012, Washington, United States. , 2012. ⟨hal-01595487⟩