Une combinaison de polymorphismes mononucléotidiques est associée à la variabilité interindividuelle de la biodisponibilité du β-carotène chez des hommes sains.
Résumé
Introduction et but de l’étude: La carence en vitamine A (VA) constitue un problème majeur de santé publique, essentiellement dans les pays en développement où elle cause le décès de plus de 600 000 enfants âgés de 1 à 5 ans chaque année. Plus de 80% des enfants entre 1 et 5 ans reçoivent des suppléments de VA préformée (rétinyl acétate) mais l’efficacité de cette stratégie est à présent remise en question. La consommation de plantes locales riches en caroténoïdes provitaminiques (α-, β-carotène et β-cryptoxanthine essentiellement), qui permet de fournir des apports réguliers en VA à des doses physiologiques, constitue une stratégie alternative. Or la biodisponibilité et la conversion en VA des caroténoïdes provitaminiques sont faibles et très variables et l’effet de cette variabilité sur le statut à long terme en β-carotène (βC), et donc en VA, n’est pas connu. Les objectifs de cette étude étaient donc d’identifier des polymorphismes mononucléotidiques (SNPs) impliqués dans la variabilité interindividuelle de la biodisponibilité du βC et de calculer si des populations avec des fréquences alléliques différentes à ces SNPs pourraient avoir des capacités d’absorption du βC différentes.
Matériel et méthodes: Trente trois hommes adultes en bonne santé ont été génotypés à l’aide de puces à ADN génome entier. Ils ont consommé un repas contenant 100 g de purée de tomate qui comprenait 0,4 mg de βC. La concentration plasmatique en βC dans les chylomicrons a été mesurée à intervalles de temps réguliers jusqu’à 8h après le repas. L’association entre des SNPs dans des gènes impliqués dans le métabolisme du βC et des lipides (54 gènes candidats représentant 2172 SNPs) et la réponse postprandiale en βC dans les chylomicrons a été analysée par régression des moindres carrés partiels (PLS regression), une approche statistique multivariée.
Résultats et Analyse statistique: La réponse postprandiale en βC dans les chylomicrons présentait une forte variabilité (CV=105%). Cette réponse était positivement corrélée à la concentration plasmatique à jeun en βC (r=0,78; p<0,001). Nous avons obtenu un modèle de régression PLS validé (p=6,5 x 10-3), comportant 25 SNPs dans 12 gènes, qui permettait d’expliquer 69% de la variance de cette réponse, c.-à-d. la biodisponibilité du βC, et permettait de prédire précisément l’absorption en βC de nos sujets (Spearman Rho=0,67 ; p<0,001 entre la réponse mesurée et la réponse prédite en βC). Conclusion: Le statut sanguin du βC est associé à sa biodisponibilité, ce qui suggère que celle-ci joue un rôle prépondérant sur ce paramètre. La variabilité interindividuelle de biodisponibilité du βC semble être modulée en partie par une combinaison de SNPs dans 12 gènes. Un calcul de la biodisponibilité théorique du βC dans les 4 populations HapMap I, qui possèdent des fréquences alléliques différentes aux SNPs identifiés dans notre modèle de régression PLS, suggère que la biodisponibilité du βC pourrait être plus élevée dans une population africaine ou asiatique que dans une population européenne.