Backbone and side-chain proton NMR assignment in fully protonated proteins: microcrystals, sedimented assemblies, and amyloid fibrils - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Angewandte Chemie International Edition Année : 2016

Festkörper NMR-Zuweisung der Rückgrat- und Seitenketten-Protonen in vollständig protonierten Proteinen: Mikrokristalle, Sedimente und Amyloidfibrillen

Backbone and side-chain proton NMR assignment in fully protonated proteins: microcrystals, sedimented assemblies, and amyloid fibrils

Andrea Pica
Sven J Saupe

Résumé

Wir beschreiben die sensitive Messung von alpha-Protonen in voll protonierten Proteinen durch Festkörper-NMR mit Rotation um den magischen Winkel (MAS) von 100-111 kHz. Die exzellente Auflösung in der Cα-Hα-Ebene wird für 5 Proteine gezeigt, darunter Mikrokristalle, ein sedimentierter Komplex, ein Kapsid und Amyloidfibrillen. Ausgehend davon wurde ein Satz 3D-Spektren für die sequenzspezifische Zuordnung der Rückgrat- und der aliphatischen Seitenketten-Resonanzen entwickelt. Dabei wurden nur 500 μg Probe verwendet. Diese Entwicklungen beschleunigen strukturelle Untersuchungen von biomolekularen Komplexen, die nur in Submilligramm-Mengen verfügbar sind, ohne die Notwendigkeit einer Deuterierung.
We demonstrate sensitive detection of alpha protons of fully protonated proteins by solid-state NMR with 100-111 kHz magic-angle spinning (MAS). The excellent resolution in the Cα-Hα plane is demonstrated for 5 proteins, including microcrystals, a sedimented complex, a capsid and amyloid fibrils. A set of 3D spectra based on a Cα-Hα detection block was developed and applied for the sequence-specific backbone and aliphatic side-chain resonance assignment using only 500 μg of sample. These developments accelerate structural studies of biomolecular assemblies available in submilligram quantities without the need of protein deuteration.
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hal-01567784 , version 1 (24-07-2017)

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Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification

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Citer

Jan Stanek, Loren B Andreas, Kristaps Jaudzems, Diane Cala, Daniela Lalli, et al.. Backbone and side-chain proton NMR assignment in fully protonated proteins: microcrystals, sedimented assemblies, and amyloid fibrils. Angewandte Chemie International Edition, 2016, 55 (50), pp.15504-15509. ⟨10.1002/anie.201607084⟩. ⟨hal-01567784⟩
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