Evaluation d’une nouvelle méthode de phénotypage de l’excrétion fécale ou de la digestibilité chez les ruminants : le Lipe®
Résumé
Il est difficile et coûteux d’estimer l’ingestion individuelle des ruminants au pâturage ou la digestibilité individuelle d’un nombre important d’animaux alimentés à l’auge. Les marqueurs utilisés actuellement (alcanes et ytterbium) nécessitent un important travail de laboratoire. L’objectif de ce travail a été de déterminer la capacité du Lipe , une lignine purifiée d’eucalyptus dosable a priori par spectroscopie infrarouge (Saliba et al, 2006), à estimer correctement l’excrétion fécale chez la vache laitière, permettant ensuite de phénotyper ingestion ou digestibilité. Le Lipe a été distribué par droguage oral 2 fois par jour (500 mg Lipe / traite) à 6 vaches laitières alimentées à l’herbe (3 régimes comparés en double carré latin 3 × 3) au cours de 3 périodes de 14 jours (printemps 2014, UMR Pegase). Les mesures précises de l’herbe ingérée et des collectes fécales les 5 derniers jours de chaque période ont permis de quantifier quantité excrétée et digestibilité des rations (18 points). Par ailleurs, à partir de fèces des mêmes animaux et des mêmes fourrages ainsi qu’à partir du Lipe , une gamme entre 0 et 1027 mg de Lipe /kg MS de fèces (n=125) a été construite. Soixante dix-sept points de la gamme ont été saisis par spectroscopie dans le proche infrarouge (SPIR) tandis que 125 points de la gamme l’ont été par spectroscopie dans le moyen infrarouge (MIR). Les 18 échantillons de l’expérimentation ont aussi été saisis à la SPIR et à la spectroscopie MIR. A partir des échantillons des gammes, 3 approches ont été utilisées pour étalonner les données d’absorbance SPIR et MIR et la proportion de Lipe dans les échantillons de fèces : a) à partir des absorbances obtenues à la longueur d’onde de 1035 cm-1 selon la recommandation de Saliba et al., 2006. b) à partir du ratio des absorbances à des longueurs d’onde 1050/1650 cm-1 selon la recommandation de Saliba et al., 2006. c) à partir de l’information obtenue dans l’ensemble des spectres MIR et SPIR respectivement, en utilisant des méthodes chimiométriques. Les modèles obtenus ont été validés par la méthode de validation croisée et utilisés pour prédire le taux de récupération de Lipe à partir des spectres des 18 échantillons de fèces obtenus dans l’expérimentation in vivo.