Découvertes de motifs pertinents pour l'analyse du transcriptome : application à l'insulino-résistance

Résumé : Les nouvelles technologies expérimentales (e. G. , puce à ADN) permettent de collecter de très grands volumes de données. Les méthodes classiques d'analyse de données ne peuvent plus s'appliquer et il y a un besoin crucial en méthodes de fouille de données pour assister les processus d'extraction de connaissances. En s'intéressant à l'analyse de données transcriptomiques, nous proposons d'extraire des hypothèses biologiquement pertinentes au moyen de motifs ensemblistes. Nous avons développé un nouvel algorithme complet d'extraction de tous les concepts formels qui satisfont des contraintes fixées par l'utilisateur. Nous l'avons utilisé sur des données originales et avons identifié de nouveaux gènes cibles du facteur de transcription SREBP1. L'extraction de concepts formels est très sensible au bruit et nous avons étudié leurs extensions pour une gestion maîtrisée des exceptions. Nous améliorons ainsi la portée de notre méthode d'analyse dans des contextes réalistes.
Type de document :
Pré-publication, Document de travail
3276; T. 2005
Liste complète des métadonnées

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01455304
Contributeur : Équipe Gestionnaire Des Publications Si Liris <>
Soumis le : vendredi 3 février 2017 - 14:34:26
Dernière modification le : samedi 4 février 2017 - 01:05:24

Identifiants

  • HAL Id : hal-01455304, version 1

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Citation

Jérémy Besson. Découvertes de motifs pertinents pour l'analyse du transcriptome : application à l'insulino-résistance. 3276; T. 2005. <hal-01455304>

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