K-Ware: vers une gestion conjointe de ressources sémantiques et leurs alignements
Résumé
ABSTRACT. There is nowadays a growing number of data sources that are annotated by meta-data and standard references. This is the case in the biomedical domain, where the usage of coding systems is usual (for instance for coding medical procedures or referencing biological analysis). These metadata that can be represented by terminologies or ontologies present some heterogeneity (level of formalism, granularity, syntax and language of the associated vocabulary , etc.) which do not facilitate the integration and secondary use of the sources that they annotate. Approaches, often based on a centralized paradigm, have been proposed for providing services which facilitate the exploration of these resources by allowing their homogeneous representation. In this work, we propose a complementary approach which preserves the semantics of the resources being managed while offering through a generic metamodel a support for their interactive visualization together with the alignments that are generated between them. The approach, implemented in the K-Ware platform, is illustrated in the cancer domain.
De plus en plus de sources de données sont annotées au moyen de métadonnées et, de référentiels métiers. C'est le cas dans le domaine biomédical, où l'utilisation de classifications est pregnante (par exemple pour le codage des actes médicaux ou le reférencement des analyses biologiques). Ces métadonnées et reférentiels qui peuvent être représentés par des ressources termino-ontologiques présentent une certaine hétérogeneité (niveau de formalisme, niveau de granuralité, syntaxe et langue du vocabulaire associé, etc.) qui ne facilite pas la réutilisation se-condaire et l'intégration des sources qu'ils annotent. Des approches ont été proposées, souvent sous la forme de hub centralisé, pour offrir des services qui facilitent l'exploration de ces res-sources termino-ontologiques en homogénisant leur représentation sous-jacente. Dans ce tra-vail, nous proposons une approche complementaire qui préserve la sémantique des ressources d'origine tout en offrant à l'aide d'un métamodèle générique un support à leur visualisation interactive ainsi que les alignements qui sont générées entre elles. Cette approche, implémentée dans la plateforme K-Ware, est illustrée sur un cas d'usage dans le domaine du cancer.
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
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