Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérie

Résumé : La production à haut-débit de données biologiques de nature hétérogène nécessite une exploitation et une intégration particulières de celles-ci. Malgré le développement de nombreuses bioontologies, l'organisation de ces données dans un cadre structuré et adaptatif reste perfectible. Nous émettons l'hypothèse qu'une approche systémique multi-échelle de la représentation des processus cellulaires permettrait de progresser dans cette problématique. Pour valider cette démarche, nous avons conçu une modélisation ontologique des processus bactériens nécessaires à l'expression génique. Les relations entre ces processus et leurs molécules participantes ou leurs sous-processus ainsi que leurs modèles ont été formellement décrites. Cette description s'accompagne d'axiomes et de relations supplémentaires sur lesquels un raisonnement automatique est effectué. La représentation des processus réalisée permet leur mise en relation avec leurs modèles et paramètres par inférence. Parallèlement, le raisonnement apporte de nouvelles informations contextuelles de séquentialité, agrégation ou compétition. Notre contribution s'appuie sur les bio-ontologies existantes pour une meilleure interopérabilité.
Document type :
Conference papers
Liste complète des métadonnées

Cited literature [3 references]  Display  Hide  Download

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01442727
Contributor : Sandra Bringay <>
Submitted on : Wednesday, February 1, 2017 - 5:04:56 PM
Last modification on : Wednesday, April 3, 2019 - 1:10:25 AM

File

IC2016_paper_36RepresentationS...
Files produced by the author(s)

Identifiers

  • HAL Id : hal-01442727, version 1

Citation

Vincent Henry, Arnaud Ferré, Christine Froidevaux, Anne Goelzer, Vincent Fromion, et al.. Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérie. IC2016: Ingénierie des Connaissances, Jun 2016, Montpellier, France. ⟨hal-01442727⟩

Share

Metrics

Record views

1056

Files downloads

240