Proceedings of the SeqBio 2015 workshop: String algorithms for bioinformatics: COMATEGE working group workshop

Alain Denise 1, 2 Olivier Lespinet 2 Mireille Régnier 3, 4
3 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau], LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, Inria Saclay - Ile de France
Résumé : Le workshop pluridisciplinaire SeqBio 2015 s’est déroulé à l’Université Paris-Sud à Orsay le 26 et 27 novembre 2015. Il réunit les communautés d’informatique et de bioinformatique travaillant sur les méthodes d’analyses des textes et les biologistes, génomiciens intéressés par la bioinformatique de séquences. Grâce au financement des GdR CNRS BIM et IM, d’Inria Saclay, du LIX, de l’I2BC et du LRI, la participation est entièrement gratuite, mais obligatoire pour des raisons de capacité limitée. Le programme comprend des exposés sélectionnés sur soumission et des exposés invités. Les thèmes abordés à SeqBio vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte à leurs applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité : algorithmique du texte structures d’indexation combinatoire et statistiques des mots algorithmique haute performance ou parallèle fouille de textes compression alignement et recherche de similarité recherche, découverte et inférence de motifs ou de répétitions analyse des données de séquençage haut-débit (génomique, RNA-seq, Chip-seq, …) annotation des génomes, prédiction de gènes haplotypes et polymorphismes génomique comparative signaux de régulation
Liste complète des métadonnées

Cited literature [37 references]  Display  Hide  Download

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01264187
Contributor : Alain Denise <>
Submitted on : Thursday, January 28, 2016 - 6:54:54 PM
Last modification on : Wednesday, April 3, 2019 - 1:57:07 AM
Document(s) archivé(s) le : Friday, April 29, 2016 - 10:30:31 AM

File

SeqBio15-Proceedings.pdf
Files produced by the author(s)

Licence


Distributed under a Creative Commons Attribution - NonCommercial - NoDerivatives 4.0 International License

Identifiers

  • HAL Id : hal-01264187, version 1

Citation

Alain Denise, Olivier Lespinet, Mireille Régnier. Proceedings of the SeqBio 2015 workshop: String algorithms for bioinformatics: COMATEGE working group workshop. Alain Denise; Olivier Lespinet; Mireille Régnier. Nov 2015, Orsay, France. 2015. ⟨hal-01264187⟩

Share

Metrics

Record views

679

Files downloads

473