Utilisation de la très haute résolution spatiale pour la caractérisation des habitats de rongeurs, vecteurs de zoonoses à La Réunion
Résumé
Connaître la distribution des espèces vectrices de zoonoses est fondamentale pour comprendre les dynamiques épidémiologiques et caractériser les zones à risque. Cette distribution peut être appréhendée à différentes échelles : régionalement, l'aire de répartition de ces espèces définit les limites d'occurrence de la transmission d'agents pathogènes et, localement, leurs niches déterminent l'aléa. Cette dernière échelle requiert une connaissance très précise des milieux qui peut être acquise par l'analyse d'images satellite à très haute résolution spatiale. Dans le cadre d'un projet de recherche sur la leptospirose à La Réunion (LeptOI), cette étude propose de mesurer le potentiel d'utilisation d'une image Pléiades (produit rééchantillonné à 50 cm) pour caractériser la distribution locale de différents petits mammifères terrestres autour de l'Etang de Saint-Paul. Trois campagnes de piégeage ont permis la capture de 134 animaux appartenant à quatre des cinq espèces présentes à La Réunion (Rattus rattus, R. norvegicus, Suncus murinus et Tenrec ecaudatus). Une analyse orientée-objet de l'image Pléiades a permis de discriminer dix classes d'occupation des sols avec une précision totale de 83,6%. Des indices paysagers ont été calculés à partir de cette classification autour de chacun des pièges (distances les plus courtes aux classes d'occupation, densité de contours et pourcentages de surface des classes au sein de zones tampon de 50 et de 100 mètres). Trois zones (« humide », « anthropisée » et « sèche ») sont clairement discriminées par ces variables, qui pourront être utilisées comme déterminants écologiques de différents profils épidémiologiques : la zone humide étant propice à la leptospirose et la zone anthropisée étant un lieu de cooccurrence des quatre espèces et ainsi potentiellement une zone d'échanges de pathogènes.
Abstract Knowing the distribution of vectors of zoonoses is fundamental to understand epidemiological dynamics and characterize risk areas. This distribution can be assessed at different scales: regionally, the range of these species defines the limits of occurrence of pathogen transmission and, locally, niches determine the hazard. This latter scale requires a very precise knowledge of the areas that can be gained through the analysis of very high spatial resolution satellite images. As part of a research project on leptospirosis in La Réunion (LeptOI), this study proposes to measure the potential of a Pleiades image (product resampled to to 50 cm) to characterize the local distribution of various small terrestrial mammals in Saint-Paul swamp area. Three trapping campaigns have led to the capture of 134 animals belonging to four of the five species occurring in Reunion Island (Rattus rattus, R. norvegicus, Suncus murinus and Tenrec ecaudatus). An object-based image analysis of the Pleiades image allowed discriminating ten land use classes with a total accuracy of 83.6%. Landscape indices were calculated from the classification around each trap (shortest distances to each land use class, edge densities and proportion of each patch within buffers defined by a 50 meters or a 100 meters radius). Three areas ("wet", "urbanized" and "dry") are clearly discriminated by these variables, which can be used as ecological determinants of different epidemiological profiles. The wetland area is known as suitable to leptospirosis whereas the urbanized area is a place of co-occurrence of the four species and thus potentially favorable to the exchange of pathogens.
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
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