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Journal articles
GARN: Sampling RNA 3D Structure Space with Game Theory and Knowledge-Based Scoring Strategies.
Mélanie Boudard
1, 2
Julie Bernauer
3, 4
Dominique Barth
1
Johanne Cohen
2
Alain Denise
5, 2, 3, 6
3
AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau], LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, Inria Saclay - Ile de France
Mélanie Boudard 1, 2
Author
Julie Bernauer 3, 4
Author
Dominique Barth 1
Author
Johanne Cohen 2
Author
Alain Denise 5, 2, 3, 6
Mail :
Author IdHAL : alain-denise
1
PRISM - Parallélisme, Réseaux, Systèmes, Modélisation (UFR des sciences PRISM
Bâtiment Descartes
45 avenue des Etats-Unis
78035 VERSAILLES - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8144 (France)
- UVSQ - Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines : FRE3709 (55 avenue de Paris - 78035 Versailles cedex - France)
2
LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI - Bâtiments 650-660 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623 (France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France)
3
AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology (Algorithmes et modèles pour la Biologie Intégrative
Bâtiment Alan Turing - Campus de l'École Polytechnique - 1 rue Honoré d'Estienne d'Orves - 91120 Palaiseau - France)
- LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] (Route de Saclay 91128 PALAISEAU CEDEX - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7161 (France)
- X - École polytechnique (École polytechnique, 91128 Palaiseau Cedex - France)
- LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI - Bâtiments 650-660 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623 (France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- Inria Saclay - Ile de France (1 rue Honoré d'Estienne d'Orves
Bâtiment Alan Turing
Campus de l'École Polytechnique
91120 Palaiseau - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
4
LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] (Route de Saclay 91128 PALAISEAU CEDEX - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7161 (France)
- X - École polytechnique (École polytechnique, 91128 Palaiseau Cedex - France)
5
BIM - BioInformatique Moléculaire (I2BC, Bâtiment 21, 1 avenue de la Terrasse, 91198 Gif/Yvette cedex - France)
- DBG - Département Biologie des Génomes (I2BC, Bâtiment 21, 1 avenue de la Terrasse, 91198 Gif/Yvette cedex - France)
- I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (Bâtiment 21, 1 avenue de la Terrasse, 91198 Gif/Yvette cedex - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRF/I2BC (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 9198 (France)
- I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (Bâtiment 21, 1 avenue de la Terrasse, 91198 Gif/Yvette cedex - France)
6
I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (Bâtiment 21, 1 avenue de la Terrasse, 91198 Gif/Yvette cedex - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRF/I2BC (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 9198 (France)
Domain :
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01201665
Contributor : Ludivine Houel <>
Submitted on : Thursday, September 17, 2015 - 4:51:38 PM
Last modification on : Monday, April 20, 2020 - 3:20:04 PM
Contributor : Ludivine Houel <>
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Last modification on : Monday, April 20, 2020 - 3:20:04 PM
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Identifiers
- HAL Id : hal-01201665, version 1
- DOI : 10.1371/journal.pone.0136444
- PUBMED : 26313379
- PUBMEDCENTRAL : PMC4551674
Collections
CNRS | INRIA | X | LIX | X-LIX | UVSQ | UMR8623 | LRI-BIOINFO | CEA | CEA-UPSAY | LRI-GALAC | I2BC | CENTRALESUPELEC | UNIV-PARIS-SACLAY | CEA-DRF | X-DEP-INFO | JOLIOT
Citation
Mélanie Boudard, Julie Bernauer, Dominique Barth, Johanne Cohen, Alain Denise. GARN: Sampling RNA 3D Structure Space with Game Theory and Knowledge-Based Scoring Strategies.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (8), pp.e0136444. ⟨10.1371/journal.pone.0136444⟩. ⟨hal-01201665⟩
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