tmle.npvi: targeted, integrative search of associations between DNA copy number and gene expression, accounting for DNA methylation: Fig. 1.

Abstract : We describe the implementation of the method introduced by Chambaz et al. (2012). We also demonstrate its genome-wide application to the integrative search of new regions with strong association between DNA copy number and gene expression accounting for DNA methylation in breast cancers. Availability and implementation: An open-source R package tmle.npvi is available from CRAN (http://cran.r-project.org/). Contact: pierre.neuvial@genopole.cnrs.fr
Type de document :
Article dans une revue
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2015, 31 (18), pp.3054-6. 〈10.1093/bioinformatics/btv320〉
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [5 références]  Voir  Masquer  Télécharger

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01113680
Contributeur : Antoine Chambaz <>
Soumis le : vendredi 6 février 2015 - 10:48:31
Dernière modification le : jeudi 16 mars 2017 - 01:07:46
Document(s) archivé(s) le : jeudi 7 mai 2015 - 10:25:35

Fichier

tmle.npvi.pdf
Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Identifiants

Collections

Citation

Antoine Chambaz, Pierre Neuvial. tmle.npvi: targeted, integrative search of associations between DNA copy number and gene expression, accounting for DNA methylation: Fig. 1.. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2015, 31 (18), pp.3054-6. 〈10.1093/bioinformatics/btv320〉. 〈hal-01113680〉

Partager

Métriques

Consultations de
la notice

338

Téléchargements du document

109