Caractérisation de peptides lasso par EPD et EDD - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2011

Caractérisation de peptides lasso par EPD et EDD

Résumé

Les peptides lasso sont des peptides bioactifs d'origine bactérienne. L'extrémité C-terminale de ces peptides est enchâssée dans un cycle macrolactame formé entre le résidu N-terminal et le carboxylate de la chaîne latérale d'un résidu glutamate ou aspartate en position 8 ou 9. La maturation d'un précurseur linéaire sous l'action de deux enzymes permet d'obtenir cette structure compacte et rigide. Notre travail consiste à caractériser par spectrométrie de masse la topologie de ces peptides en forme de lasso. Leur fragmentation est comparée à celle de peptides synthétiques possédant une topologie différente avec le même enchaînement d'acides aminés: peptide lactame non-lasso ou peptide linéaire. La microcine J25 (MccJ25), peptide lasso antibactérien produit par Escherichia coli AY25 [1], a d'abord été étudiée par spectrométrie de masse en mode positif (CID, IRMPD et ECD) [2]. Dans cet exposé nous présenterons les résultats obtenus sur cette molécule en mode négatif par activation vibrationnelle (CID) et électronique (EDD, EPD). Les expériences EPD (Electron Photodetachment Dissociation) ont été réalisées sur un LTQ modifié équipé d'un laser à 266 nm [3], tandis que les expériences EDD (Electron Detachment Dissociation) ont été réalisées sur un FTICR [2] avec des électrons d'environ 20 eV. La MccJ25 contient deux tyrosines capables d'absorber l'UV à 266 nm, induisant le détachement d'électron à l'origine des fragmentations observées en EPD. Afin de préciser le rôle de chaque tyrosine en EPD, nous avons étudié deux variants de MccJ25 produits par mutagenèse dirigée, dans lesquels chaque tyrosine est sélectivement substituée par une phénylalanine. Par ailleurs des expériences de double-résonance ont été réalisées en EDD sur le FT-ICR en faisant varier l'amplitude d'éjection de l'ion de charge réduite au cours de l'irradiation par les électrons [4]. Ces expériences fournissent des informations sur la cinétique de formation des fragments et nous ont permis de différencier plusieurs mécanismes de fragmentation.

Mots clés

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-00960742 , version 1 (18-03-2014)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00960742 , version 1

Citer

Marie Pérot-Taillandier, Carlos Afonso, Séverine Zirah, Quentin Enjalbert, Rodolphe Antoine, et al.. Caractérisation de peptides lasso par EPD et EDD. Congrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2011), Sep 2011, Avignon, France. ⟨hal-00960742⟩
122 Consultations
0 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More