Fouille de motifs séquentiels pour la découverte de relations entre gènes et maladies rares

Nicolas Béchet (1) , Peggy Cellier (2) , Thierry Charnois (1) , Bruno Crémilleux (1)

1 Equipe CODAG - Laboratoire GREYC - UMR6072
2 LIS - Logical Information Systems

Orphanet est un organisme dont l'objectif est notamment de rassembler des collections d'articles traitant de maladies rares. Cependant, l'acquisition de nouvelles connaissances dans ce domaine est actuellement réalisée manuellement. Dès lors, obtenir de nouvelles informations relatives aux maladies rares est un processus chronophage. Permettre d'obtenir ces informations de manière automatique est donc un enjeu important. Dans ce contexte, nous proposons d'aborder la question de l'extraction de relations entre gènes et maladies rares en utilisant des approches de fouille de données, plus particulièrement de fouille de motifs séquentiels sous contraintes. Nos expérimentations montrent l'intérêt de notre approche pour l'extraction de relations entre gènes et maladies rares à partir de résumés d'articles de PubMed

Mots clés: maladies rares; patrons linguistiques; extraction d'information; Fouille de données; motifs séquentiels

Domaines: Intelligence artificielle [cs.AI]

Nicolas Béchet, Peggy Cellier, Thierry Charnois, Bruno Crémilleux. Fouille de motifs séquentiels pour la découverte de relations entre gènes et maladies rares. 23es Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances - IC 2012, Jun 2012, Paris, France. pp.149-164. ⟨hal-00816111⟩