Graph Algorithms and Software Framework for Interactive RNA Structure Modelling

Fabrice Jossinet; Alexis Lamiable; Philippe Rinaudo; Liza Al-Shikhley; Franck Quessette; Sandrine Vial; Dominique Barth; Eric Westhof; Alain Denise

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Graph Algorithms and Software Framework for Interactive RNA Structure Modelling

Fabrice Jossinet ¹ Alexis Lamiable ^{2, 3} Philippe Rinaudo ^{2, 3, 4} Liza Al-Shikhley ¹ Franck Quessette ³ Sandrine Vial ³ Dominique Barth ³ Eric Westhof ¹ Alain Denise ^{2, 4, 5}

1 ARN - Architecture et Réactivité de l'ARN

2 LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique

3 PRISM - Parallélisme, Réseaux, Systèmes, Modélisation

4 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology

LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau], LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, Inria Saclay - Ile de France

5 IGM - Institut de génétique et microbiologie [Orsay]

Fabrice Jossinet ¹ AuthorId : 482020

Author

Alexis Lamiable ^{2, 3} AuthorId : 159935
Author

Philippe Rinaudo ^{2, 3, 4} AuthorId : 787473
Author

Liza Al-Shikhley ¹ AuthorId : 731750
Author

Franck Quessette ³ AuthorId : 131493

Author IdHAL : franck-quessette

Sandrine Vial ³ AuthorId : 369475

Author IdHAL : sandrine-vial

Dominique Barth ³ AuthorId : 145595

Author

Eric Westhof ¹ AuthorId : 482012

Author

Alain Denise ^{2, 4, 5} AuthorId : 743451

Author IdHAL : alain-denise

1 ARN - Architecture et Réactivité de l'ARN (Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire 15 rue René Descartes 67084 STRASBOURG Cedex - France) StructId : 93780

CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UPR9002 (France) StructId : 441569
IBMC - Institut de biologie moléculaire et cellulaire (I.B.M.C. 15 Rue René Descartes 67084 STRASBOURG CEDEX - France) StructId : 1956
- UNISTRA - Université de Strasbourg (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : FRC1589 (France) StructId : 441569
UNISTRA - Université de Strasbourg (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013

2 LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI - Bâtiments 650-660 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex - France) StructId : 2544

UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France) StructId : 92966
Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623 (France) StructId : 441569

3 PRISM - Parallélisme, Réseaux, Systèmes, Modélisation (UFR des sciences PRISM Bâtiment Descartes 45 avenue des Etats-Unis 78035 VERSAILLES - France) StructId : 31978

UVSQ - Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines : FRE3709 (55 avenue de Paris - 78035 Versailles cedex - France) StructId : 81173
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8144 (France) StructId : 441569

4 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology (Algorithmes et modèles pour la Biologie Intégrative Bâtiment Alan Turing - Campus de l'École Polytechnique - 1 rue Honoré d'Estienne d'Orves - 91120 Palaiseau - France) StructId : 103784

LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] (Route de Saclay 91128 PALAISEAU CEDEX - France) StructId : 2071
- X - École polytechnique (École polytechnique, 91128 Palaiseau Cedex - France) StructId : 300340
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7161 (France) StructId : 441569
LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI - Bâtiments 650-660 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex - France) StructId : 2544
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France) StructId : 92966
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
- CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623 (France) StructId : 441569
UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France) StructId : 92966
Inria Saclay - Ile de France (1 rue Honoré d'Estienne d'Orves Bâtiment Alan Turing Campus de l'École Polytechnique 91120 Palaiseau - France) StructId : 118511
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009

5 IGM - Institut de génétique et microbiologie [Orsay] (Bâtiments 400 et 409 UFR des Sciences - Université Paris-Sud 11 15, rue Georges Clémenceau - F 91405 ORSAY Cedex - France) StructId : 1361

UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France) StructId : 92966
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8621 (France) StructId : 441569

Document type :

Conference papers

Domain :

Computer Science [cs] / Bioinformatics [q-bio.QM]

Life Sciences [q-bio] / Quantitative Methods [q-bio.QM]

Liste complète des métadonnées

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00756345
Contributor : Alain Denise <>
Submitted on : Thursday, November 22, 2012 - 6:57:37 PM
Last modification on : Wednesday, March 27, 2019 - 4:41:29 PM

Identifiers

HAL Id : hal-00756345, version 1

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Citation

Fabrice Jossinet, Alexis Lamiable, Philippe Rinaudo, Liza Al-Shikhley, Franck Quessette, et al.. Graph Algorithms and Software Framework for Interactive RNA Structure Modelling. Journees Ouvertes de Biologie Informatique et Mathematiques - JOBIM'12, Jul 2012, Rennes, France. pp.475-476, 2012. 〈hal-00756345〉

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