Projet ANR EVALUFQ-VOL : Persistance des enterobacteriacae resistantes aux fluoroquinolones dans le sol après épandage de fumier de volailles

P. Dabert (1) , A.M. Pourcher (1) , C. Ziebal (1) , M. Kervarrec (1) , S. Le Roux (1) , R. Maurice (2) , P. Cotinet (3) , Alain Jadas-Hécart (4) , P.Y. Communal (4) , R. Moraru (5) , I. Kempf (2)

1 UR GERE - Gestion environnementale et traitement biologique des déchets
2 Laboratoire de Ploufragan - Plouzané
3 Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne
4 LETG-Angers - Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique
5 FII - Facultatea de Informatica, Iasi

Deux fumiers frais, l'un issu de poulets de chair conventionnels non traités et l'autre de poulets traités à l'enrofloxacine (BaytrilND) pendant cinq jours à la dose thérapeutique, ont été épandus sur céréales à raison de 8 T /ha. Une quantification des entérobactéries et des résidus d'antibiotique a été réalisée sur les fumiers à la sortie du bâtiment d'élevage et dans le sol pendant 2 mois après épandage. La proportion de bactéries résistantes à 32 mg/L de ciprofloxacine (métabolite de l'enrofloxacine) dans les fumiers en sortie du bâtiment était inférieure à 0,003% pour les animaux non traités et d'environ 2% pour les animaux traités. Les concentrations en enrofloxacine et ciprofloxacine correspondantes étaient de 11 et 1 mg/kg pour les fumiers d'animaux traités respectivement, et inférieures à la limite de quantification pour les fumiers d'animaux non traités. L'apport de fumier a augmenté d'un facteur 10 les teneurs en entérobactéries présentes dans le sol et a conduit à des concentrations en enrofloxacine voisines de 20 μg/kg et en limite de quantification pour la ciprofloxacine. Ces teneurs en antibiotiques ont peu évolué au cours des deux mois suivant l'épandage. Aucune entérobactérie résistante à la ciprofloxacine n'a été observée dans le sol épandu avec du fumier d'animaux non traités. En revanche, les bactéries résistantes à 1 mg /L de ciprofloxacine représentaient environ 60% des entérobactéries totales 7 jours après l'épandage du fumier d'animaux traités. Cette proportion a diminué au cours du temps et aucune résistance n'a été observée un mois après l'épandage. Des Escherichia coli (bactérie fécale) ont cependant été détectés deux mois après l'épandage. 114 colonies recueillies tout au long de l'expérience ont été analysées par typage moléculaire (PCR ERIC). L'analyse des profils distingue 51 souches représentées par une à 19 colonies. Elle démontre la persistance d'une souche depuis le fumier traité jusqu'au sol 7 jours après l'épandage et la persistance d'une autre souche d'E. coli sur le sol pendant au moins 41 jours. / Two fresh manure, one from broiler conventional untreated and the other from chickens treated with enrofloxacin (BaytrilND) for five days at the therapeutic dose, have been applied to cereals at 8 T / ha. Quantification of enterobacteria and antibiotic residues was conducted on manure leaving the barn and land for 2 months after application. The proportion of bacteria resistant to 32 mg / L of ciprofloxacin (metabolite of enrofloxacin) in manure at the output of the building was less than 0.003% for untreated animals and about 2% for treated animals. The concentrations of enrofloxacin and ciprofloxacin were respectively 11 and 1 mg / kg for animals treated manure, and below the limit of quantification (LOQ) for the manure of untreated animals. The manure application increased by 10-fold the level of enterobacteria in soil and led to concentrations of enrofloxacin close to 20 μg / kg and LOQ for ciprofloxacin. These levels of antibiotics did not really change over two months after application. No enterobacteria resistant to ciprofloxacin was observed in soil receiving manure from untreated animals. However, bacteria resistant to more than 1 mg / L of ciprofloxacin accounted for about 60% of total enterobacteria 7 days after application of manure from treated animals. This proportion decreased over time and no resistance was observed one month after application. Escherichia coli (faecal bacteria) were detected two months after application. 114 colonies collected throughout the experiment were analyzed by a molecular typing method (ERIC PCR). The analysis of the profiles distinguished 51 strains represented by one to 19 colonies. It demonstrated the persistence of a strain from the treated manure up to soil until 7 days after application and the persistence of another strain of E. coli on soil for at least 41 days.

Mots clés: FIENTES; VOLAILLE; EPANDAGE; ANTIBIOTIQUE

Domaines: Environnement et Société

P. Dabert, A.M. Pourcher, C. Ziebal, M. Kervarrec, S. Le Roux, et al.. Projet ANR EVALUFQ-VOL : Persistance des enterobacteriacae resistantes aux fluoroquinolones dans le sol après épandage de fumier de volailles. 9èmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2011, Tours, France. 5 p. ⟨hal-00654213⟩