Motifs Séquentiels Discriminants pour les puces ADN

Résumé : Découvrir de nouvelles informations sur les groupes de gènes impliqués dans une maladie est un véritable challenge. Les puces ADN sont des outils puissants pour l'analyse des expressions de gènes. Elles mesurent l'expression de milliers de gènes dans différentes conditions biologiques. Dans cet article, nous proposons une nouvelle approche mettant en évidence des relations d'ordre entre les expressions de gènes. Tout d'abord, nous extrayons des motifs séquentiels qui peuvent être utilisés comme matériel d'étude par les biologistes. Or, comme la densité des bases issues des puces à ADN rend difficile l'extraction de ces motifs, nous introduisons une source de connaissances pendant le processus de fouille. De cette manière, l'espace de recherche est réduit et les résultats obtenus sont plus pertinents d'un point de vue biologique. Les expérimentations sur des données réelles soulignent la pertinence de notre proposition.
Document type :
Conference papers
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00525256
Contributor : Import Ws Irstea <>
Submitted on : Monday, October 11, 2010 - 2:50:41 PM
Last modification on : Wednesday, September 18, 2019 - 4:04:04 PM
Long-term archiving on : Thursday, October 25, 2012 - 4:50:44 PM

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  • HAL Id : hal-00525256, version 1
  • IRSTEA : PUB00028445

Citation

Paola Salle, Sandra Bringay, Maguelonne Teisseire. Motifs Séquentiels Discriminants pour les puces ADN. InforSID: Informatique des organisations et Systèmes d'Information et de Décision, May 2009, Toulouse, France. pp.397-412. ⟨hal-00525256⟩

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